活疫苗免疫后常见的反应有：甩头，流泪，打喷嚏，呼噜，咳嗽等，这种反应一般在免疫后第2天～4天出现，再过5天～6天反应较重，以后逐渐减轻；有时出现精神不振、采食减少、拉绿色粪便等现象。常引起免疫反应的疫苗有ILT、IBD、ND等。
有些活疫苗可以根据是否出现反应来确定免疫效果。如鸡痘疫苗接种后4天，接种部位可出现轻微肿胀，并出现黄色或红色的结痂，反应持续3天～4天后减轻，14天～21天结痂消失。如没出现这种反应，应在5天～7天后补种。球虫疫苗免疫后，个别鸡群拉红色粪便，可自行恢复。传喉冻干苗涂肛后，肛门黏膜发红，有炎症，标志免疫效果良好。一般来说，疫苗接种途径的侵蚀性愈强，则疫苗反应就愈强烈，但产生的免疫力也愈强。例如，点眼法的侵害性强于粗粒喷雾，但产生的免疫力也强于粗粒喷雾，而粗粒喷雾的效果又优于饮水免疫。
由于其他因素的影响，如疫苗的种类、毒力、接种量、免疫途径、鸡群的健康状况、敏感性以及是否发生细菌性感染等，免疫接种后常出现严重的反应，如生长率和饲料报酬降低，抵抗力下降，在病原微生物的侵害下极易引起发病，死淘率和药物费用增加。