畜禽免疫失败就是畜禽虽然已接种了某种疫苗，但在规定的免疫期内仍发生这种传染病或抗体监测时达不到应有的抗体水平。畜禽免疫失败，主要原因如下：
１．疫苗的质量
①国内使用的畜禽疫苗，必须由兽用预防用生物制品生产企业按照特定的规程和质量标准生产，并经中国兽医药品监察所批准同意；对进口疫苗必须先注册登记，批准进口后经中国兽医药品监察所检验合格，并加贴“中国兽药监督”防伪标识，方能销售使用。一些未经批准的中试产品，其生产条件和规程不稳定，导致免疫力下降。
②疫苗须有良好的运输方式，才能产生良好的预防效果。运输过程中疫苗的包装受损会造成疫苗污染或失效。
③疫苗保存方法要恰当。每种疫苗都有各自的保存方法，有的是冷藏保存，有的是冷冻保存，有的是在２℃～１５℃温度条件下保存，有的是在８℃～２５℃温度条件下保存，但不论哪种方法，都要避光保存。④疫苗的有效期。所有疫苗都规定了有效期，超过有效期的疫苗不得使用。有的疫苗在不同温度中保存，有效期是不一样的，如鸡新城疫Ⅰ系活疫苗，-15℃的温度条件下保存有效期为２年，２℃～８℃温度条件下保存有效期为８个月。
２．疫苗的使用 免疫程序要合理，畜禽防疫要因地制宜，本地没有的传染病一般不要主动防疫，经常发生的疫病要加强防疫。疫苗必须按使用说明书正确使用，操作方法不当，随意改变也会造成免疫失败。
①疫苗接种剂量过少。在注射过程中因药液流失造成注射量未达到要求；滴鼻点眼时因追求速度而不等吸收完即放鸡，使鸡摔头时疫苗损失或漏防；气雾免疫时畜禽舍风过大，造成疫苗流失过多。
②操作不规范。针头未及时更换和消毒；疫苗稀释时计算失误或稀释不匀导致计量不准确；疫苗经稀释后或开瓶后未在规定时间内用完。
③疫苗选择不当。如在疫病严重流行的地区，仅选用安全性好而免疫力较低的品系。
④免疫方法失误。如饮水免疫使用了含氯的自来水、金属饮水器或水中有残留的消毒药，饮水免疫前没给畜禽断水，饮水量过大，半小时内未饮完，造成疫苗效力下降；气雾免疫使用压力过高，喷出的瞬间温度超过８０℃，从而杀死了活毒；应皮下接种的疫苗错误地作了肌肉注射接种或采取滴鼻滴眼式接种，将疫苗用错了地方。
⑤抗菌素干扰。接种弱毒活菌苗时畜禽未停止使用添加有抗菌药物的饲料。
