我国连续三年遭受高致病性禽流感侵袭。特别是2005年，禽流感疫情传播之广，危害时间之长，扑杀家禽之多，防控难度之大，是前所未有的。禽流感就像笼罩在家禽业上空的一片阴影挥之不去。虽然禽流感给家禽业造成了巨大损失，但是，疫情也推进了我国家禽业向现代化发展的步伐。
一是推进了防疫意识增强我国禽流感疫情频发充分暴露出家禽业动物防疫意识淡薄，特别是那些小规模分散饲养户对动物疫病的防控，缺乏足够的认识与重视，不仅不注意采取防控措施，而且乱扔死鸡死鸭以及吃死鸡死鸭的现象普遍，导致禽流感疫情发生与传播。禽流感使这些小规模分散饲养户深刻反思自己的动物防疫意识是否适应防控动物疫病的要求，是否掌握防控禽流感等动物疫病的知识与技术，认真检查饲养条件与饲养管理是否符合动物防疫的规定，各项动物防疫措施是否确实到位，对发现的问题积极进行整改，消除隐患，确保自身和周围家禽饲养的安全。
二是推进了防疫体系建设建国以来，我国动物防疫体系几乎一直处于改革之中。在多数情况下，改革都没有脱离“脱钩”、“断奶”或“下放”的怪圈，破坏了动物防疫体系，削弱了动物防疫能力。禽流感暴发充分暴露了我国动物防疫体系的薄弱，整个行业深刻认识到完善动物防疫体系的重要性和必要性，推进了动物防疫体系建设的步伐。2005年下半年，新疆接连发生了9起禽流感疫情，自治区党委和政府进行了深刻的理性思考。11月26日，新疆召开了动物防疫体系建设暨兽医管理体制改革工作会议，提出五个方面改革：一是健全兽医行政管理机构；二是整合、归并现有动物防疫、检疫、监督机构及其行政执法职能；三是在自治区和地州两级组建动物疫病控制与诊断中心，县级组建畜牧兽医站，三级机构均为全额预算管理的事业单位；四是健全强化基层动物防疫机构；五是加强村级动物防疫网络建设。除新疆外，江苏、浙江、河北、甘肃省改革方案已经进入实施阶段，其它省也提出了改革方案或初步方案。
三是推进了生产方式转变禽流感疫情频频出现，与家禽生产方式落后有很大关系。禽流感让家禽从业者充分认识到从传统落后的小规模分散饲养方式向现代科学的规模饲养方式转变势在必行。2004年防控禽流感，一些地方就提出了禁止家禽散放散养的要求。2005年，禁止散放散养力度进一步加大。在此基础上，一些地方把转变传统饲养方式作为畜牧业发展目标。北京市提出2006年要改变传统散养的饲养方式，杜绝人畜同院和不同畜禽混养。南京市计划在“十一五”期间实施“退户入园”战略，彻底改变一家一户的家禽饲养方式。在转变畜禽饲养方式上，山东省走在了全国的前面，取得了明显的效果。为什么山东省养禽业能连续两年远离禽流感？除了严格防控外，养禽业集约化、标准化程度高是重要因素，高水平的科学饲养方式给安全生产立起了屏障。
