在鸡不同生长阶段有选择、有针对性地应用一些药物预防鸡病的发生是早已被公认的，是一种切实可行的办法，但是应用不当会适得其反。一些养鸡户认为，药物有保健、防病和促生长的作用，就无目的、无针对性地长期在饲料或饮水中添加，有的添加至肉鸡出栏，蛋鸡添加至淘汰，从不间断用药，甚至倍量添加，导致如下恶果。
1、病原菌产生耐药性。长期滥用抗菌素类药物导致病原菌产生耐药性，并且可使一种病原菌产生多种耐药性，一旦耐药病原菌引发疾病就难以治疗。
2、病毒产生耐药性变异株。抗病毒的化学药物大多只能抑制病毒，长期滥用化学类的抗病毒药物会使多种病毒对现有的抗病毒药物产生耐药性变异株，甚至还会出现依赖药物的变异，使长期应用抗病毒药物防病的效果不佳或根本无效。
3、机体免疫功能下降。大量抗菌素、抗病毒类药物长期作用于鸡体组织器官，会使淋巴细胞的抗体合成活动受到抑制，导致机体自身免疫功能下降，容易受病原微生物的侵害而发病。
4、引发肝肾综合征。 因长期大量滥用药物，使肝肾不堪负重，造成机体肝肾损伤、机能下降，影响发病时治疗药物的转化吸收，使疾病更难治愈。
