近年来，我州以深化畜牧业供给侧结构性改革为主线，以优化供给、提质增效、农民增收为目标，强化畜牧业科技支撑，调整优化养殖结构，着力推进畜牧业转型升级。2017年，全州肉类产量56万吨、奶类产量32万吨、禽蛋产量10.7万吨，肉、奶、蛋人均占有量全省排名第一。
全面提升畜牧业发展质量。全州畜禽养殖污染防治“十三五”规划启动实施，禁养区划定工作全面启动。2017年，在洱源县、祥云县、巍山县、永平县启动牛羊生产重点县粮改饲试点，实施粮改饲6.2万亩，推广青贮饲料18.6万吨；全面落实新一轮草原生态保护补助奖励机制，对已完成家庭承包的1274万亩天然草原全面实施补助奖励，累计实施退耕还草4.24万亩。加强畜禽良种繁育体系建设，总投资1亿元的大理州家畜繁育指导站搬迁扩建项目主体工程已完成。全州25个生猪定点屠宰场（点）全部纳入监管，通过生猪屠宰“扫雷行动”，深入开展生猪定点屠宰场清理整顿，兽药饲料监管工作不断强化。
持续强化畜牧业科技支撑。加快推进全州畜牧业科技推广运用及成果转化，2017年，全州完成猪种改良60万窝，其中人工授精32万窝；推广良种禽2450万羽；加工利用青贮饲料50万吨，推广人工牧草种植20万亩、专用青贮玉米种植6万亩；奶牛良种覆盖率100%、生猪良种覆盖率90%、肉牛良种覆盖率45%、羊良种覆盖率70%。不断扩大畜禽规模养殖比重，以适应养殖结构优化和供给侧结构改革的需要，畜禽标准化、规模化养殖不断发展。截至目前，全州通过畜牧部门备案的畜禽规模养殖场（小区）达2322个，累计创建国家级畜禽标准化示范场6个、省级21个；建成5个万头猪场、3个万亩高原生态牧场、5个千头肉牛场、5个千只羊场、2个千头奶牛场、10个出栏10万羽的肉鸡场、5个存栏10万羽的蛋鸡场、350个奶牛家庭牧场。
着力推动畜牧产业化发展。全州拥有州级以上畜牧产业化龙头企业21家，其中省级以上6家。全州乳品加工企业不断整合发展壮大，从2005年的13家整合为目前的3家，日处理鲜奶能力1560吨。云南欧亚乳业、新希望邓川蝶泉乳业为农业产业化国家级重点龙头企业，云南皇氏来思尔乳业为省级龙头企业。全州现有永平阿巧嬢清真肉食品、云龙诺邓火腿、弥渡卷蹄等肉食品加工企业，年加工能力约4万吨。全州现有中小型饲料加工企业30多家，年饲料产销量上百万吨。全州建有生物有机肥加工厂6座，年收集加工畜禽粪便18万吨。全州共有18家畜牧企业通过无公害农产品产地认定，2家畜牧企业通过绿色食品认证，云龙诺邓火腿、南涧县无量山乌骨鸡、云龙矮脚鸡通过国家地理标志认证。