萧山区畜牧兽医局主要承担全区重大动物疫病的防控、动物和动物产品的检疫、动物卫生监督执法、畜产品安全监管等政府公共管理职能。近年来，在加强鲜奶、兽药、饲料、添加剂、畜禽肉等畜产品防疫监管方面做了大量的工作，确保了公共卫生安全。
2011年，区畜牧兽医局除了继续强化动物防疫监管外，同时加强了内部安全管理。一是加强安全宣传教育，凡节假日利用农民信箱等短信平台提醒广大职工关好门窗及电器，做好防火防盗等防范工作；二是开展消防安全检查，对单位内的防火设施、用电设备、取暖设备进行一次安全隐患排查，对高容量、高压力电器设备进行线路分流分压，为兽医实验室配备了消防箱、灭火器；三是进一步加强车辆管理，强化驾驶员安全意识教育，出台了有关严格遵守道路交通安全的规定。
