到2008年，伊犁州直良种牛比例提高到60％，经过改良的新疆褐牛，每头产肉量增加30公斤至50公斤。
伊犁河谷是我国著名的牧区，也是新疆不可多得的纯天然“肉库”。当地干部群众通过长期牧业实践逐步认识到：传统畜牧业规模化扩张方式最终必然导致草场大面积退化，唯有通过品种改良，提高牲畜个体生产性能，才能实现草地畜牧业可持续发展。
新疆褐牛是伊犁河谷畜牧业一大品牌，也是当地农牧民增收的重要来源。多年来，伊犁州直各县市通过冷配、胚胎移植、建立繁育中心等手段，对新疆褐牛进行品种改良。最高的年份，伊犁州直牛冷配达到20万头，胚胎移植3500头，占全国一半以上。
这几年，伊犁州直牛的胚胎移植数量呈逐年递减趋势，去年减少到400多头。原因是牛的品种从整体上已经有了明显提高，在这种情况下，农牧民选择成本更低的冷配技术，同样可以获得良种牛犊。
2008年，伊犁哈萨克自治州畜牧部门还引进了性控技术。截至今年4月下旬，6000头采用这项新技术的母牛已经成功产下1000多头小母牛。
伊犁当地的哈萨克羊生产性能同样有待提高。目前伊犁州畜牧部门已经在特克斯、尼勒克等地建立了150个良种哈萨克羊核心群。另外州畜牧部门还通过引进产肉性能更优的萨伏克羊，对本地羊进行杂交改良。
伊犁河谷作为“天马故乡”，有大小马匹35万匹。马除了骑乘，能否产生更好的效益？这几年当地畜牧部门引进英国纯血马对本地马进行改良，培养轻型赛马。另外还引进顿河马来培育肉用马，引进吉尔吉斯马培育乳用马，都取得一定成效。一般的马每天只能产3公斤至4公斤奶，吉尔吉斯马产奶量可达12公斤。
