经过20多年的持续快速发展，我国畜牧业生产方式正在发生历史性的转变，已进入由传统产业向现代产业转型的关键时期。
畜牧业生产水平不断提高。2005年，全国畜牧业总产值突破1.3万亿元，占农业总产值的34%，农民人均来自畜牧业的收入超过600元，约占农民家庭经营现金收入的30%，一些畜牧业发达地区，畜牧业现金收入已占到农民现金收入的50%左右，成为农民增收的亮点。2005年，全国肉类总产量7743.1万吨，比2000年增长26.4%，年均递增4.8%；禽蛋产量2879.5万吨，增长28.4%，年均递增5.1%；奶类产量2864.8万吨，增长2.12倍，年均递增25.5%。
畜牧生产逐步向优势区域集中。近年来，农业部根据不同区域资源、技术、市场和产业基础状况，优化要素组合，大力推进优势畜产品产业带建设。目前，全国畜产品优势区域布局趋于合理，优势产业带逐步形成。13个生猪主产省猪肉产量已占全国的76.8%；肉牛产业带8个省区牛肉产量占全国的66.3%；肉羊产业带14个省（区、市）羊肉产量占全国的80.5%；7个奶业主产省（区、市）牛奶产量占全国的62.2%；10个家禽主产省出栏家禽占全国的73.1%，禽蛋产量占全国的79.2%。
畜牧产业化经营步伐加快。目前，全国农业产业化龙头企业有580多个，其中畜牧业产业化龙头企业占30%。畜牧业专业经济合作组织接近4万个。畜牧业规模化养殖不断提高，全国年出栏生猪50头以上、肉鸡2000只以上、奶牛5头以上的规模化养殖比例均比2000年提高十几个百分点。
标准化养殖小区快速发展。目前，全国各类养殖小区已突破6万个。据调查，各类养殖小区约有76%能够规范使用饲料、兽药等投入品。今年，农业部在山东、山西、黑龙江、浙江、河南、四川、陕西7个省，选择了20个奶牛和生猪养殖小区，实施标准化畜禽养殖小区试点项目，先期重点建设粪便和污水无害化处理设施。农业部还将制定《养殖小区建设与管理规范》，指导各地养殖小区建设，推进清洁养殖、健康生产。
畜禽良种繁育体系逐步完善。国家近几年来共安排国债资金近10亿元，支持各地改扩建畜禽良种繁育场、基因库、种公牛站、测定中心和检测中心等，使畜禽良种生产供应能力和检测水平得到明显提高，畜禽良种普及率也进一步提高。
2005年农业部实施了《全国畜禽良种工程二期建设规划》，河北、内蒙古、黑龙江和山西4省（区）还实施了奶牛良种冻精补贴项目。今年，全国奶牛良种补贴资金将扩大到1亿元。
