兽医实验室监测诊断是我国目前最准确、最权威的动物疫病监测诊断技术手段，其结果也是制定疫病防控策略和措施的重要依据。
阿坝州畜牧兽医局非常重视实验室动物疫病监测诊断工作。2008年在工作经费紧张、防疫工作压力大的情况下，挤出资金购买实验室仪器设备、诊断试剂、药品器械等，抽出技术人员开展口蹄疫、禽流感、猪瘟和鸡新城疫等强制免疫病种的免疫抗体水平检测及灾后重大动物疫病和人畜共患病的监测。监测结果为摸清我州疫情形势、制定符合阿坝州实际情况的疫病防控方案和免疫程序提供客观科学的依据。今年11月，阿坝州畜牧兽医局在若尔盖县举办县级兽医实验室监测诊断操作技能培训会，为县级开展动物疫病监测诊断工作打下了基础。
目前，州动物疫病监测诊断中心能够开展实验室免疫抗体水平检测，病原菌的分离培养及初步鉴定，布病、炭疽等动物疫病的诊断等实验活动。
