中牧股份公司的生物制品业务主要分为禽用疫苗、畜用疫苗和特种疫苗等三类，是国内产品品种最全，产能规模最大，质量稳定优良，市场占有率第一的骨干企业，这部分业务的盈利能力很强。公司是首家获国家农业部批准禽流感疫苗生产企业，生产能力超过130亿羽(份)，产品毛利率60％左右，属高盈利产品。目前经农业部正式批准9家禽流感疫苗定点生产企业中，南京梅里亚(占50％)和乾元浩生物(占52.92％)均为公司控股子公司。南京梅里亚是全球第一大动物疫苗生产商，乾元浩生物产品还实现出口。
公司产品还有猪伪狂犬灭活疫苗(一类新兽药证书、国家重点产品)、猪伪狂犬病基因缺失疫苗(二类新兽药证书、国家科技进步二等奖)；同时在猪蓝耳、猪乙脑等开发获得重大突破；拥有国内第一家宠物疫苗厂，公司还以2400万元新建生物转化超级泰乐菌素项目，一期产能为年产42吨超级泰乐菌素(该产品获国家三类新兽药证书)。公司在疫苗业的龙头地位将给公司长期增长带来保障。
