新药研制的核心之一是从大量的化合物样品库中发现有药理活性的化合物。通常从10000个化合物中筛选出有药理活性的化合物不到1个。只有建立庞大的供筛样品库，才能保证新药可以源源不断的开发出来，保证新药研发的可持续发展。国际上大医药公司通常有几十至上百万的化合物实物样品库，可提供自动化的药物筛选。而我国可用于药物筛选的化合物非常缺乏，这严重影响新药发现进程。利用高性能计算机进行虚拟药物筛选是一条崭新的途径。首先通过计算机筛选化合物数据库，可使得实际筛选的化合物集中上千倍。由于计算机药物筛选具有非常好的应用前景和经济社会效率，以及庞大的计算要求,迫切需要新一代的计算技术予于支撑.
开发新药研发应用网格的目的就是要利用网格环境和网格计算资源，进行新药筛选服务。它具有统一应用网格界面，用户经身份论证后,只需提交作业即可获得结果而无需考虑如何实现。本网格的计算资源的利用最终是基于最大限度的利用国家网格的空闲计算资源。无论是那个计算中心的超级计算机或者计算机机群，只要加入药物研发应用网格，其空闲计算资源就可能被应用；然而，一旦计算资源繁忙，我们的网格应用就会自动让出计算资源，通过网格格点内和格点间的进程调整和负载控制来完成应用任务。
由中科院上海药物研究所、江南计算机技术研究所、上海交通大学和香港大学联合于2002年向科技部申请国家863高技术项目基金并获得批准；同年通过了科技部863项目专家组的详细方案评审；2004年7月通过了科技部863项目专家组中期考核。按照课题合同的规定，本项目预定于2004年12月推出试用版；2005年6月通过正式版，提供使用。通过建立针对因特网环境的高效通信模式，采用网格格点内和格点间的双重负载平衡技术，最大限度的利用国家网格的空闲计算资源,新药研发应用网格平台为用户提供高吞吐量和安全的新药筛选服务。目前，中科院上海药物研究所、北京摩力可药业有限公司和香港大学的多个超级计算机和计算机机群等计算资源加入到本应用网格平台，形成了超过每秒万亿次浮点运算能力；另外本项目正在接入上海超级计算中心新安装的十万亿次曙光4000超级计算机，进一步拓展计算能力；同时本平台扩大了药物筛选的容量，配备了200多万化合物三维结构和药物信息数据库资源，新增了药物化学信息服务功能。
截止到目前，已有抗糖尿病、抗关节炎等新药研究项目正在利用本网格平台进行计算机药物筛选，相关研究成果已经申请了3项新药