近年来，南美白对虾的养殖规模逐步增加，但南美白对虾病害流行仍不容乐观，有近50%的养殖虾池不同程度地出现病害，给养殖业造成了严重地损失。因此，有效地控制和防治病害是提高养殖效益的重要途径。
1、预防为主，综合防治
应坚持“预防为主，综合防治”的原则。从池塘水质、苗种、饲料及日常管理多方面入手，以降低疾病的发生率。保证无毒健康虾苗进入养殖环境，放苗前作好清塘消毒，放苗后定期进行水体消毒，并定期在饲料中添加大蒜素、维生素C和维生素E等，增强南美白对虾的抗病能力。在养殖过程中，做到定期改良养虾池中的底质状况，如采用“三合一”底质改良剂：即平炉渣、活性碳和沸石复合制剂（平炉渣含有氧化亚铁，可有效转化池底的硫化氢、活性碳和沸石可大量吸氨，减轻池底污染程度），抑制对虾传染性病原的繁殖。在南美白对虾养殖过程中，保持合理的养殖容量可以有效控制病原体的繁衍。
2、合理准确地使用药物
正确地使用药物，可以最大限度地降低病害造成的损失，因此，药物的选择也至关重要。抗病毒药物可以有效阻断病毒的核酸合成，从而有效抑制病毒的繁殖。如针对“拖拉病毒”综合症，采用多种中草药中提取的复合抗病毒药物“白虾红体消”治疗，有明显作用；二溴海因复合消毒剂是一种高效价的新型消毒剂，用其消毒发病水体，可在短时间、低浓度下迅速杀死或抑制致病原，能有效地控制南美白对虾暴发性传染病的发生。
3、微生态制剂的应用
在水体中使用有益微生物菌群（如光合细菌、芽孢杆菌、硝化细菌及蛭弧菌等的复合制剂和枯草杆菌等），可以加速水体的氨氮转化为硝酸盐，硝酸盐则被浮游生物有效利用，改善水质及底质环境；同时由于高剂量投入，有益菌群在水体中短时间内形成优势种群，抑制了其它病原微生物的繁殖，可以将继发性感染源控制在较低水平，从而间接控制了对虾传染性疾病的发生和发展。微生态制剂不能与消毒剂和抗生素同时使用，一般用药3天后等药性基本消失再使用，半个月内不需换水。
4、生物制品的应用
生物制品在南美白对虾的疾病防治上起着重要的作用，在饲料中添加免疫增强剂如免疫多糖、β-葡聚糖和生物活性物质对对虾的病害控制具有明显的作用。免疫增强剂的使用既能提高对虾成活率又能显着促进生长，同时能减少抗生素类药物的用量，有利于对虾养殖业的健康发展。因此，在南美白虾养殖过程中使用生物制品，可以增强机体抵抗疾病的能力，减少病害感染，从而提高南美白对虾的养殖成活率。