一、接种时间不当。雏鸡身上有母源抗体，一般在1～2周内不易感染鸡新城疫。如接种过早，反而和母源抗体中和；接种过迟，因体内抗体消失，易被毒力强的野毒侵染发病。所以，一般接种时间应在孵出后7～10天。
二、疫苗质量问题。
1、部分单位生产的疫苗质量不过关，接种后不能产生相应免疫力。
2、由于某些细菌、病毒存在变异株，使疫苗本身的保护率达不到100%。
3、不同的疫苗所需的运输、保存条件不同，冻干疫苗一般需要-15℃以下冷冻保存，湿苗一般在0～4℃保存，油乳剂疫苗的保存温度一般在10℃左右。应尽量选择出厂时间较近的疫苗，以保证免疫效果。一般疫苗稀释在4小时内要用完，用不完即作废。
三、疫苗稀释不当。各种疫苗所需用的稀释剂、稀释倍数及稀释的方法都有一定的规定，必须严格地按照使用说明书进行操作。疫苗稀释用水，从严格上讲应用灭菌生理盐水，否则会降低免疫效果。疫苗要现用现稀释，不可使用稀释后放置时间过长的疫苗。如果饮水免疫的疫苗稀释不均，部分鸡饮量不足等也会影响免疫效果。
四、免疫剂量不准。目前疫苗免疫剂量存在两种误区：一是免疫剂量不足，二是使用大剂量疫苗免疫，二者都不科学。因此，在购买疫苗时，在考虑到免疫接种过程中的损失和浪费外（损失量一般按15%-20%计算），不要随意加大免疫用量。
五、稀释量不准。通常注射稀释量比较容易确定，而点眼和饮水免疫量则比较困难，应依据实际情况确定。
六、接种方法有误。不同的疫苗要求接种途很不同，免疫时一定要按规定的方法接种。饮水免疫时须加0.5%脱脂奶粉，并要求在2小时内饮完。
七、鸡体的状况不佳。鸡群营养不良、患病，尤其是患传染性法氏囊病以后，接种其它疫苗时往往会形成免疫抑制，使之不能产生免疫或免疫力极低，甚至引起鸡只死亡。免疫接种应安排在鸡群健康时进行，否则将影响免疫效果。
八、由于管理上的疏忽，造成免疫失败。如滴鼻、点眼时，疫苗未被吸收而又未补点，造成漏免，导致免疫失败。在疫苗稀释或接种的过程中，消毒药物过多地残留于注射器或直接接触疫苗，也能造成疫苗失效或减效。所以，在接种疫苗的前两天或后两天要避免进行带鸡消毒，这一点要引起重视。