防治鱼病选用鱼药，应严格按照国家和有关部门的规定，以不危害人类健康和破坏水域生态环境为基础，以“三效”“三小”为原则。
所谓“三效”是指对鱼病的防治效果高效、速效和长效；“三小”是指药物的毒性小、副作用小和用量小。目前，市场上符合“三效”“三小”原则的常用鱼药有：
一、用语防治细菌、病毒性水产养殖动物疾病和改善水域环境的犬齿泼洒鱼药有：氧化钙（生石灰）、漂白粉、二氯异氰尿酸钠、三氯异氰尿酸、二氧化氯、二溴海因、四烷基季胺盐络合碘等。
二、常用灭杀和控制寄生虫性原虫病的鱼药有：绿化钠（食盐）、硫酸铜、硫酸亚铁、高锰酸钾、敌百虫等，这些鱼药常用于浸浴机体，挂篓和全池泼洒。
三、常用于内服的鱼药有：土霉素、口恶喹酸、磺胺嘧啶和磺胺甲口恶喹酸。
四、常用的中草药有：大蒜、大蒜粉素、大黄、黄芩、黄柏、五倍子、空心莲和苦参等，可以用总草药浸液全池泼洒和拌饵内服。
