规模化猪场疫病控制与净化，在8周龄是免役仔猪，6-7月龄攻毒，保护率可达87。5%，在有母源抗体存在时，其抗体效价是仔猪对口蹄疫疫苗免疫应答高低的关键，再已有的报道中，几乎无一例外地声称母源抗体严重抑制仔猪对口蹄疫疫苗免疫的应答。仔猪在1、2、4周另或8周另免役至6月龄攻毒，结果无一头获得保护。在21日另、28日另、40日另和60日另仔猪接种灭活苗后，分别检测抗体，结果表明40日另和60日另仔猪产生抗体水平更高。有的学者认为仔猪在4周另前不宜接种口蹄疫油左剂疫苗，以免疫母源抗体的干扰。而在3、4月令注射疫苗则不会受到母源抗体的影响。
母猪的免疫状况也是影响仔猪免疫的一个重要因素。因为哺乳期的母猪血清抗体和初乳抗体的类别和效价与仔猪的血清抗体类别及效价一致，母猪再怀孕初期和分娩前一个月各接种一次灭活苗，所产仔猪的抗体水平高。并且经两次免疫的母猪本身能100%达到耐受口蹄疫病毒感染的抗体水平，而免疫一次的母猪只有75%达到这种水平。
国内的实验资料表明，母猪在分娩前2个月接种灭活苗所产仔猪的母源抗体仅维持1周，看来应在妊娠期两次接种疫苗较为可靠。
再受到疫情严重威胁的情况下，为确保价格昂贵的种猪安全，可使用口蹄疫血清或高免血清，每千克体重皮下注射0。5-1。0毫升，24小时后即可抗击强度的感染，保护期为20-30天。根据兰州兽医研究所中和仿制组的实验结果，建议口蹄疫型灭活苗的用户，按以下免疫程序接种型灭活苗；
种猪每隔3个月免疫一次，每次肌注常规苗2毫升/头，或肌注高效疫苗1-1。5毫升/头。
仔猪40-45日另首免，常规苗肌注2毫升/头或高效苗1毫升/头。
100-105日另育成猪加强免疫一次（即二免），常规苗肌注2毫升/头或高效苗1-1。5毫升/头。
