奶牛粪便的评判虽不能对营养问题提供确定的回答。但它确是一个很有用的诊断工具，对许多营养问题的发生，它能给予很多的暗示和对问题解决的启示。通过结合其他的诊断工具，可帮助解决营养问题。
对粪便3个方面的观察
颜色
粪便的颜色可随饲料的品种、胆汁浓度和饲料的消化率而变化。采食含较多谷物的典型TMR日粮时，粪便通常是黄褐色。如果奶牛正腹泻，粪便的颜色将变成灰色。正接受疾病治疗的奶牛，其粪便可能会因所用药物的作用而呈异常。痢疾和球虫病引起的肠道出血，其粪便呈黑色和带血样。而像沙门氏菌引起的细菌感染，就产生浅黄色或浅绿色腹泻粪样。
黏稠度
正常粪便中的物质具中度的粥样黏稠度，可形成一个圆顶型堆积体，高度在2.5厘米~5.0厘米之间。腹泻不但可由中毒、感染和寄生虫引起，也可由碳水化合物在后肠过度发酵和产酸引起。稀松的粪便也可能由采食过多的蛋白或高水平的瘤胃降解蛋白产生，它是需要消耗更多的水分通过尿液排除过多氮的结果。限制饮水和限制蛋白进食量常常产生坚硬的粪便，严重脱水时粪便呈坚硬的球状，左侧真胃移位的奶牛，其粪便为糊状。
内容物
理想的粪便应表现对绝大部分饲料和营养均匀一致的消化和利用。如果我们看到粪便中含有大量未消化的谷物和长粗饲料（大于1.27厘米），那就说明瘤胃发酵功能有问题，或较多的后肠发酵和大肠发酵。相对于瘤胃发酵，后肠发酵效果和价值较低，这是因为后肠营养物质的吸收率较低。其原因可能是有效纤维采食不够，没能有效刺激瘤胃反刍和保持正常的瘤胃pH值所致。干粪便的表面如有白色呈现，说明有未消化的淀粉存在，淀粉越多，白色越明显。
粪便中可看到较多黏液的话，表明有慢性炎症或肠道受损，有时也能看到黏蛋白管型物在其中，这些都说明大肠有损伤，是由过度的后肠发酵和过低的pH值所引起。
粪便中如有气泡，表明奶牛可能乳酸酸中毒或由后肠过度发酵产生气体所致。
粪便的评分
不同的产奶阶段奶牛粪便的推荐值为：
●干奶牛 3.5
●干奶后期 3.0
●新产牛 2.5
●高产牛 3.0
●产奶后期牛3.5