对腹泻的治疗原则是清查病因、整肠止泻、调理胃肠、对症治疗。
清查病因 对于细菌性肠道病，筛选合理的抗菌药物尤为重要，如环丙沙星、卡那霉素、穿心莲、黄连素等；针对病毒性肠道病，在抗菌消炎的同时，可配伍白头翁、苦参、博落回、血见愁等清热解毒、凉血止痢的中药注射液进行治疗；对寄生虫性腹泻可合理选用伊维菌素、阿苯达唑等驱虫药口服或肌注。对球虫性腹泻可选用磺胺类药、地克珠利或盐霉素进行治疗。
整肠止泻 当病猪排粪迟缓或者虽排恶臭稀粪而胃肠内仍积滞大量异常内容物时，病初可选用人工盐、食盐加适量防腐消毒药内服，后期则以灌服液体石蜡为好。当病猪肠内积粪已基本排尽，粪的臭味不大时，可选用吸附剂和收敛剂如木炭末、矽碳银等内服。
调理肠胃 为了恢复胃肠功能，可服用帮助消化的药物，常用的有胃蛋白酶、乳酶生、酵母、稀盐酸等。
对症治疗 为缓解病猪脱水和自体中毒，对于有饮欲的病猪可用口服补液盐让其自由饮用，对于无饮欲且脱水的病猪可给予葡萄糖生理盐水、碳酸氢钠进行静脉注射，当静脉注射确实有困难时，可进行腹腔注射，亦可通过胃导管灌服或直肠补给。
