（1） 通过基因工程手段替换引起多肽不稳定的残基或引入能增加多肽稳定性的残基，可提高多肽的稳定性。
（2）化学修饰
研究最多的是PEG修饰。PEG是一种水溶性高分子化合物，在体内可降解，无毒。PEG与多肽结合后能提高热稳定性，抵抗蛋白酶的降解，降低抗原性，延长体内半衰期。选择合适的修饰方法和控制修饰程度可体质或提高原生物活性。
（3）添加剂
通过加入添加剂，如糖类、多元醇、明胶、氨基酸和某些盐类，可以提高多肽的稳定性。糖和多元醇在低浓度下迫使更多的水分子围绕在蛋白质周围，因而提高了多肽的稳定性。在冻干过程中，上述物质还可以取代水而与多肽形成氢键来稳定多肽的天然构象，而且还可以提高冻干制品的玻璃化温度。
（4）冻干
多肽发生的一系列化学反应如脱酰胺、β-消除、水解等都需要水参与，水还可以作为其它反应剂的流动相。另外，水含量降低可使多肽的变性温度升高。因此，冻干可提高多肽的稳定性。
多肽类药物制剂研究常用的分析手段有：SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法、等到电聚焦电泳法、凝胶过滤层析法、反相液相层析法、紫外光谱法、荧光光谱法、红外光谱法、圆二色性光谱法、量热法以及生物活性测定法。这里仅介绍药物制剂研究中常用的一种方法——
量热法（Calorimetry）。
量热法是通过测定样品在受热过程中的放热和吸热过程中的放热和吸热行为来研究样品在受热过程中的放热和吸热行为来研究样品中各组份的相互作用及状态变化的一种方法，常用的是差示扫描量热法（Differentiat Scanning Calorinetry）。该方法广泛用于多肽的热稳定性分析、各种添加剂对多肽结构的影响、多肽与配基之间的相互作用等研究，还用于测定冻干物品的玻璃化温度和共熔点。例如.Chan等用DSC研究了添加剂对rhDNase溶液热变性的影响。蛋白质浓度为10mg/ml,扫描速率为1.2C/ min。测得rhDNase在纯水中的Tm=67.4C,Hm=18.0J/g。加入Ca2+有利于rhDNase的热稳定，加入Mg2+、Mn2+则不利于rhDNase的稳定。当CaDl2浓度为20-100mmol/L时，Tm=76.4℃，Hm=20-22J/g。CaDl2和乳糖对rhDNase的稳定有符合作用。同时加50mmol/L CaDl2和100mg/ml乳糖，可使rhDNase的Tm值提高到76.4℃，Hm值到21.9J/g。Chang等用DSC测定了rhIL-lra制剂的玻璃化温度、反玻璃化温度和共熔点。冷冻蛋白制剂的各种物理变化，如玻璃化、反玻璃化和共熔点都会影响冻干过程。根据测定结果，作者确定了冻干温度和升温速度，仅用6个小时就完成冻干过程。
