1、环境因素。在正常的免疫反应出现之前，若环境中存在大量病原微生物，使用任何疫苗都不可能收到最佳效果。如：雏鸡出壳后即接种马立克氏病疫苗，但需要经过2周时间后，才能获得良好的免疫力，如果在2周之内鸡舍被马立克氏病毒污染，病毒就会侵入机体，造成免疫力下降，甚至发生马立克氏病。因此，疫苗应尽早应用，用后还要加强环境监控、搞好消毒工作。
2、母源抗体水平。新生动物可以从母体、初乳或禽的卵黄中获得一定量的母源抗体，这是畜禽最早抵抗微生物感染的有生力量。如果在母源抗体水平还比较高的情况下接种疫苗，就会使疫苗与抗体发生中和反应，既消耗了母源抗体，又损失了疫苗数量，无法刺激机体产生足够的抗体，使免疫效果下降，甚至导致免疫失败。因此，幼龄动物免疫接种前，应进行母源抗体检测，当母源抗体水平下降到临界值时，才可以进行免疫接种。
3、免疫抑制性疾病。有些疾病主要侵害免疫系统，发生这样的疾病后，体内淋巴细胞减少，若进行免疫接种，免疫应答即会受到抑制，就很难出现理想的免疫效果。如早期患有传染性法氏囊病的鸡群，患有传染性贫血的鸡群，使用疫苗进行免疫接种，都不会达到预期的免疫目的。
4、营养因素。多种营养物质，如蛋白质、维生素A、维生素E、硒、锌等，都与免疫抗体的产生和免疫功能的发挥有密切关系，如果缺少这些物质，就会影响免疫抗体的产生，导致免疫功能下降，从而影响免疫效果。因此，免疫接种前一定要注意补足各种营养成分，以便为免疫力的产生提供足够的物质条件。
5、免疫方法失误。免疫方法失误是导致免疫失败的主要人为因素，如疫苗品种不对、疫苗保存不好、疫苗稀释不当、注射剂量不足、免疫途径错误、未经严格消毒等，都无法产生理想的免疫效果。免疫接种前做好计划，接种时耐心细致、谨慎从事，防止出现各种失误，就会避免人为因素导致的免疫失败。
6、不良应激因素。免疫接种前后出现的各种不良应激因素，都会扰乱机体的正常代谢，影响抗体产生的速度和数量。因此，免疫接种前后，一定要加强饲养管理，搞好饲料更换工作，调整好群体密度，控制好舍内温度、湿度和通风，避免出现严重的噪音和突然的惊吓。
