1.发病原因不一样
母猪子宫内膜炎
子宫在正常情况下是无菌状态，因为子宫颈是关闭的，而且有黏液堵住起“栓塞”作用(发情时黏液会排出而出现所谓的“流白”)。所以，在怀孕35天以上死亡的胚胎，由于没有细菌参与腐败分解，死胎水分被吸收而成为“干尸”——木乃伊。
子宫内膜炎，通常是子宫黏膜的黏液性或脓性炎症。其病因通常是在子宫颈打开的阶段，如配种、分娩及难产助产时，由于细菌的侵入而感染。
母猪阴道炎
阴道通常是“有菌”状态，不过大多数是有益菌如乳酸菌，使阴道处于一种酸性的“抑菌”环境，使存在的条件性致病菌也处于一种“平衡”状态而不致病。
阴道炎大多数是由于阴道酸性环境改变使阴道菌群平衡失调导致的，比如在应激、体质下降时，也可能因为阴道损伤而致其他细菌侵入而致。
2.发病表现不一样
母猪子宫内膜炎
多发生于配种后、产后及流产后，表现为黏液性及黏液脓性，呈黄色或脓样，母猪体温稍升高，食欲减少，有时出现弓腰、努责及排尿姿势，从生殖道排出灰白色混浊含有絮状物的分泌物或脓性分泌物。患猪卧下时排出较多。
母猪阴道炎
通常是在交配、分娩、助产及阴道检查时，受到损伤和感染而发生，也可能是后备母猪在霉菌毒素中毒、免疫抑制性疾病、亚健康状态，加之环境潮湿、卫生条件差等情况下阴道菌群平衡失调而发生。母猪从阴门流出的炎性分泌物，其分泌物量少而浓稠。
常附着于阴门周围、尾根及臀部，阴道黏膜出现肿胀、充血、疼痛等，有时因为瘙痒而摩擦墙壁、栏杆。
3.危害不一样
母猪子宫内膜炎
由于炎症产生的不适，可能引起不发情，即使发情配上种，也由于炎症所产生有毒物质可致死精和胚胎死亡，导致母猪不孕。
母猪阴道炎
可能因为阴道肿胀、疼痛而拒绝交配，但配上种后，一般不会引起胚胎死亡而致不孕。
子宫内膜炎预防思路是清晰的，但执行到位并不容易!
预防子宫内膜炎(包括阴道炎)的清晰思路，PSY应用研究院朱中平院长提出六大细节：
第一，无菌操作
首先，一定要教育员工：清洁不等于无菌。
无菌的要点是：洗洗更健康?配种前杜绝清水冲洗，而应该用0.1%高锰酸钾水冲洗，而后再用无菌蒸馏水冲洗;输精过程无菌操作;接产时，严格无菌操作，尤其不要认为只要手洗干净了，就可以伸进产道助产;对产道的所有操作都应该温柔进行，避免阴道损伤。
第二，让母猪尽可能多且持续产生“爱情激素或幸福激素”
一个优秀的配种员，应该围绕在输精过程中让母猪尽可能多且持续产生“爱情激素或幸福激素”——催产素。
这种“爱情激素”会产生最奇妙的效果：
一是产生有节律的收缩，使精液“吸入”子宫，并送达精卵结合的输卵管壶腹部;
二是有利于产生更多的雌激素，而高浓度的雌激素有利于子宫的防御机制，引起子宫液体增加。加之组织通透性增加，并且加强了白细胞在子宫中的迁移，从而减少子宫内膜炎的发生。
所以笔者认为，人工授精操作，态度比技术更重要。
