根据对多个养猪场在走访及剖检发现，即使在一些表面健康的猪群体内，同样还潜伏着多种病源，在以后的生产过程中随时都还有暴发的可能，造成这些潜伏病源的主要原因还是存在于防疫方面。
一、猪体先天性携带病源过多
因这些年外来品种的引进，引起外来病源与本地病源的混合感染，一些高产品种未经过特定病源的净化，先天性携带病源已经是不可避免的因素，这些因素主要表现在繁殖障碍性疫病方面，如繁殖与呼吸道综合征、萎缩性鼻炎、伪狂犬等。
二、防疫漏洞过多
从2001年开始，养殖场防疫出现了漏洞，最主要的就是养猪户受到多方面的误导，如减少防疫种类的误导，认为一些疾病在发病时多种抗生素都能起到一定的治疗效果，于是就存在着侥幸心理，为了省事省钱，干脆就不做，如猪丹毒、猪肺疫、链球菌等。
三、防疫程序不规范
有些养猪场虽然比较重视防疫，但因没有具体实用的防疫程序，多种疫苗的预防时间与剂量上普遍存在着问题，甚至有个别的养猪场仅在哺乳期1个月就安排了6种疫苗，从而造成部分甚至全部疫苗预防上的失败，所以在发病时认为自己的防疫做的都比较到位，百思其解却找不到发病的原因。
四、滥用抗生素
因防疫上的漏洞，养猪户为了保证猪群的健康，只好依靠长期大量的使用广谱抗生素进行预防性治疗，过分地依赖于抗生素的预防作用不但导致猪体内病源对抗生素产生耐药性，而且大量的药残对猪内脏也造成了巨大的负担，严重影响到肝脏的解毒功能与肾脏和排毒功能，造成体内多数器官肿大，直接威胁到猪群的健康生长。
所有这些问题直接造成猪群长期处于一种亚健康状态，抗病能力弱，生长受阻，稍有感冒发热就引起整体的症状表现，治疗起来难度大，体内药残又直接影响到治疗时用药的效果，导致频频反复，大大的增加了伤亡率及治疗费用。
因受到前期存在的这些问题的影响，今年在养猪管理是除了尽量维持现有猪群的正常生长，还须注意：
1． 疫苗的质量。疫苗的质量是保证猪群产生免疫能力最关键的一项，如果疫苗的运输与保存过程中出现质量问题，造成的后果将是相当的严重的，有些养猪场频频出现阶段性的生产成绩波动，有很大一部分因素是由疫苗的质量问题造成的。绝大多数养猪场在疫苗的保存上采用的都是普通的家用冰箱，箱内温度波动大，极易造成疫苗质量问题，所以，建议在疫苗的保存上最好使用恒温冰箱，确保疫苗的保存上不出现问题。
2． 加强防疫。根据该场猪群的健康状况，分析出对该场猪威胁较大的疫病，然后制订出最佳的防疫与保健程序，尽量把繁殖猪群的抗体高峰安排在哺乳期，减少哺乳期仔猪的用药与疫苗预防。
做疫苗预防时必须保证疫苗的剂量，尤其要考虑到注射过程中可能造成的药剂损失，保证有足够的疫苗注射到猪体内。
注射疫苗后一定要对注射部位进行严格的消毒，尤其是一些活疫苗，如果注射后的消毒不严格，泄漏在猪体外的疫苗病毒将直接变成野毒，危害到整体猪群的健康。
3． 控制抗生素的使用。在做好防疫的基础上，应尽量减少抗生素的使用量，不但可以降低饲养成本，减少猪体内在药残，减轻对内脏造成的负担，同时在遇到疾病发生时，猪体的耐药性也相对较低，容易达到较高的治疗效果。
4． 合理用药。中药是我国的国粹，在大多数慢性病的治疗上要远比西药效果好，尤其在清热解毒方面，西药更是远远不及。医学上有“西药治标，中药治本”的说法，所以，在疾病预防及治疗上，要采取标本兼治的方法，一方面用西药控制病情，另一方面要使用中药治本，根除病源，尤其是繁殖猪群，在场里饲养的时间较长，一定要治本。
