众所周知，动物传染病严重危害畜牧业生产，它不仅能引起大批畜禽患病死亡，影响畜牧业的经济效益，而且某些人畜共患的传染病还严重威胁人民身体健康，影响公共卫生。动物传染病流行必须具备三个基本环节，即传染源、传播途径和易感动物群。兽医消毒的目的就是杀灭或清除传染源排出到外界环境中的病原微生物，从而切断流行过程中的连续性，阻止动物传染病的传播。兽医消毒不仅是兽医卫生工作中的一项重要措施，也是预防兽医学的主要内容之一，概括起来，具有以下几个方面的作用:
1 防止动物传染病的发生和传播
在动物传染病的防制，兽医消毒的主要环节是切断传播途径。传染病的传播途径是指病原微生物从传染源排出后侵入新的动物体之前，在外界环境停留、转移所经历的全过程。不同的传染病其传播途径不尽相同，消毒工作的重点也就不同。经消化道传播的传染病，如仔猪副伤寒、禽霍乱、大肠杆菌引起的肠炎、炭疽、猪瘟、鸡新城疫、病毒性胃肠炎等，是通过被传染性微生物污染的饲料、饮水、饲养工具等传播的，搞好环境卫生，加强饲料、饮水和饲养工具的消毒，在预防这类传染病上有重要的作用;经呼吸道传播的传染病，如鸡传染性气管炎、猪气喘病、猪流行性感冒、结核病、腺病毒感染、疱疹病毒感染等，患病动物在呼吸、咳嗽、喷嚏时将病原微生物排入空气中，并污染环境物体的表面，然后通过气末和空气传播给健康动物，为了预防这类传染病，对污染的畜禽舍内空气和物体进行表面消毒，具有重要意义;一些接触性传染病，如狂犬病等，主要是通过病毒和健康的动物皮肤、粘膜的直接接触传播的，控制这类传染病可通过对动物皮肤、粘膜和有关工具的消毒来预防;某些传染病，如乙型脑炎、马传染性贫血等，是由昆虫及一些节肢动物传播的，这些传染病的预防必须采取杀虫等综合性措施。
2 控制动物病原微生物感染和发病
目前已知的动物传染病约20多种，但这并不是由病原微生物引起和与微生物有关的全部疾病，尚有相当一部分未包括在传染病之内，例如外科感染、肿瘤、泌尿系统感染、神经系统感染、由病毒或细菌引起的变态反应性疾病等，这些疾病虽然没有明确的传染源，但其病原体都来自于外界环境，自身体表或自然腔道等，为预防这类感染和疾病的发生，对外界环境、畜禽体表及腔道、畜牧生产和兽医诊疗的各个环节采取预防性消毒和防腐措施，也是非常必要的。当这些疾病发生时，对于病畜禽排出的病原体更应及时进行彻底的消毒处理。
3 保护畜牧业经济的发展
动物传染病给畜牧业造成的经济损失是十分巨大的，有些传染病如牛瘟、鸡新城疫、猪瘟、禽流感等常引起动物毁灭性的死亡。据记载，欧洲各国在18 世纪由于牛瘟猖獗流行，仅法国自1713～1764年就死亡10100万头。解放前，牛瘟给我国养牛业造成的损失也是极为严重的，仅1938～1941年青海、甘肃、四川诸省的一次大流行，均引起惨重的经济损失。
某些动物传染病的死亡率虽不高，但能使家畜、家禽发育迟滞，生产性能降低(如产乳、产卵量减少，役用能力丧失以及肉、皮、毛等畜产品废弃等)，同样给畜牧业经济造成严重损失，如口蹄疫等所造成的经济损失并不次于某些毁灭性传染病。因此，做好兽医消毒工作，采取综合防制措施，预防和控制各种传染病，对减少因传染病的发生和流行所造成的经济损失，保护畜牧业生产的发展，提高畜牧业经济效益有着极其重要的作用。
4 保障人民身体健康
人畜共患病如口蹄疫、禽流感、布鲁氏菌病、结核病、炭疽、狂犬病、弓形虫病等，一方面给动物造成危害，另一方面严重影响人类的健康。据报道，一般情况下，人类炭疽的病原体来自家畜，每发现1000头炭疽家畜的同时，就能发现200个左右的炭疽病人，这些病人大多为畜产品处理、加工的工人及与病畜接触的人员。另据调查，在42.8%的结核病人中发现有牛型结核杆菌。其它如布鲁氏菌病、炭疽、口蹄疫、狂犬病等疾病的病人，绝大部分都有与患者相应疫病病畜接触的病史。只要做好兽医消毒工作，加强人类自身保护，就可大大减少人类感染机会，保障人民身体健康。从这个意义上讲，兽医消毒工作在医学和公共卫生学上也有重要的作用。
