一是参池换水条件不畅通。参池地势高低不平，池内水深不一，进排水闸门悬在离池底40厘米以上，水交换时一直留有很深的“死水”。还有部分参池建在离海岸几千米甚至万米处，进排水使用同一个渠道，致使水质质量差，交换量小，进水处无过滤和沉淀池。
二是虾池筑礁不合理。有的参池采用石礁，石块小，间距与堆距都在5米~6米之间；有的参池采用编织袋装泥，仅三袋搭成三角形，间距与堆距也在5米~6米；还有的采用瓦片搭成人字形，刚进水就被潮水冲垮，既不利于海参栖息与度夏，又不利于底栖硅藻的附着，阻碍了海参的正常生活与摄食。
三是清淤消毒不彻底，导致水质败坏。有很多参池养殖多年很少清淤和消毒，使池底和礁石堆积了很深的海参粪便、淤泥和杂藻，尤其是池底的低温藻类，经过冬、夏两季后开始腐烂变质，从而滋生出细菌、霉菌等多种病菌，影响了海参的正常生长，最终导致海参瘦小体弱而发病。