1、维生素含量问题。玉米中含有丰富的VE，而B族维生素含量较低；而小麦中含有丰富的B族维生素，而VE含量偏低。这个问题可以提高调整日粮中VE的添加量来解决。6、对鸡蛋品质的影响。由于小麦中色素含量较少，会间接影响到蛋黄颜色，使蛋黄颜色稍浅，但对鸡蛋的风味无不良影响。所以对于不着重要求蛋黄颜色的普通商品蛋鸡，可以不考虑此影响，而某些品种鸡，可通过添加食用色素等来解决。而由于小麦中含有丰富的B族维生素，有利于维持粘膜完整，提高蛋清粘稠度，并使蛋壳呈现诱人的光泽。
2、氨基酸平衡问题。优质玉米的粗蛋白含量为8.7%，而小麦的粗蛋白含量高达13.9%，在谷物类饲料中名列前茅，因此使用小麦替代玉米，同时要减少一部分豆粕用量。但对蛋鸡来说，小麦的氨基酸比例不尽合理，主要是赖氨酸水平偏低。因此，在使用小麦型饲料时需要额外添加一定量的赖氨酸，同时将日粮中的粗蛋白水平略微提高，以数量换平衡。
3、小麦的能值低于玉米，可能会导致日粮能量偏低。据NRC的标准，12%水分的小麦禽代谢能为3040大卡/kg，而14%水分的优质玉米禽代谢能值为3240大卡/kg，比小麦高出200大卡。据大量实验表明，在添加足量复合小麦酶之后，可提高小麦的禽代谢能值140~230大卡/kg，已经基本与优质玉米相当。而市售玉米，特别是山东本地玉米，水分往往在16%左右甚至更高，而且其中杂质较多，霉变状况时有出现，其代谢能甚至不足3150大卡/kg，而市售小麦的水分多在10%~12%之间，其代谢能值甚至比玉米还略有优势。
4、亚油酸问题。玉米中油脂含量高于小麦，使用小麦型日粮，可能会出现亚油酸不足的现象，可通过添加菜饼、油脂等方法解决。
