1、鸡呼吸系统结构的生理特点所决定
由鸡的解剖特点可知，鸡的呼吸系统主要由上呼吸道、气管、肺和气囊组成。尽管上呼吸道黏膜有一定的防御机制，但是，由于其禽类特有的气囊结构，与外界相通，没有特殊的防御体系，且与各器官直接接触，是一种开放结构。费景春等报道了如果鸡舍内空气等原因可破坏呼吸道黏膜的完整性，一旦病原微生物突破了黏膜的防线，便可长驱直入，引发呼吸道感染，进而造成全身眭感染，从而诱发多种疾病。
2、疫苗接种的应激反应
在兽医临床上，疫苗免疫是疾病防控过程中最主要的措施之一，但是，肉鸡的呼吸道黏膜也受疫苗的刺激发生一定的应激反应。在畜牧生产实践中，由于大量使用法氏囊或新城疫疫苗导致的免疫抑制，是引发肉鸡呼吸道疾病的重要原因之一。
3、疾病防治不科学
在动物生产实践中，由于疫苗预防不科学或不及时，错过了疫苗最佳的免疫时间，导致疫苗免疫滞后，使这种免疫达不到应用的效果。同时由于一些药物治疗不科学，像有些疾病的毒株或耐药株不断突变，常常导致临床治疗无效。如果使用药物的浓度或作用时间不佳，可导致耐药菌株的增多，降低了药物治疗细菌性疾病的疗效。
4、气候因素
例如气候的变化，温度忽冷忽热，都会为病原体的感染提供条件。应激可以导致机体的抵抗力减弱，抗应激能力降低。再者转群也是机体容易感染呼吸道疾病的原因之一，再加之天气变化等应激因素存在时，容易引起鸡只咳嗽等呼吸道症状疾病。
5、环境卫生因素
没有严格的环境卫生管理制度，例如经常不消毒或者消毒不及时，再者由于鸡场地势低洼、粪便堆积、高密度饲养、通风不好，使得鸡舍内有害气体不能有效排出，特别是硫化氢、氨气、甲烷等气体严重超出标准，刺激机体呼吸道黏膜，容易使机体的组织缺氧，呼吸道及肺呼吸的功能下降，致使机体的抵抗力下降，机体变成了易感动物群，外界的一些病原微生物容易侵入机体内。
