鸡只呼吸系统结构的特殊性 鸡所特有的气囊结构，使鸡呼吸系统从鼻到肺、至腹腔脏器乃至骨骼及相关组织成一“开放”系统。这意味着鸡只呼吸系统的感染很容易扩散至鸡腹腔脏器甚至全身，一旦气管/支气管黏液-纤毛系统、肺泡巨噬细胞吞噬系统受到损害，鸡只呼吸系统疾病便会发生。
管理因素 饲养密度过大，通风不良，温度过高或过低，湿度过大或过小，维生素和微量元素的缺乏，日粮中蛋白与能量的比例失衡，霉菌毒素的污染，均会损伤上呼吸道系统结构的完整性，进而引起呼吸系统疾病。
疾病因素 引起鸡呼吸系统综合征的常见疾病有新城疫、传支、禽流感、传喉、传鼻、大肠杆菌病、霉形体感染等，其中霉形体感染是引起禽呼吸系统综合征最常见的病因。
免疫抑制性疾病的影响 传染性法氏囊病、传染性白血病、网状内皮系统组织增生症、马立克氏病、传染性贫血、呼肠孤病毒感染等免疫抑制性疾病，破坏了鸡只的免疫系统，使鸡只产生了免疫抑制，对各种传染性疾病的易感性增强。
总之，以上影响鸡呼吸系统综合征发生的各种因素常常具有相互作用，使机体的抵抗能力下降，常继发一些条件性呼吸道疾病如大肠杆菌病、霉形体感染等。有时在实际中也可见到一些呼吸系统疾病的混合发生，如新城疫+大肠杆菌病+支原体感染、传鼻+支原体感染等，其加重了疾病的发病程度，造成严重的损失。
