控制苍蝇的方法可分为三大类，即物理方法、生物学方法和化学方法，而最有效的控制措施是综合使用这三种方法。
1、物理方法
在畜禽场内使用的物理方法就是及时地清除粪便，应特别注意死角中的粪便和污水，尽可能保持畜禽粪便干燥。首先应搞好畜禽场内的清洁卫生，定期消毒。其次要妥善处理清除的粪便，及时拉走或堆积发酵处理。畜禽场内的废旧垫料和病死畜禽也要妥善处理。对禽场要定期检查饮水和喂料系统，确保不漏水、不洒料。捡蛋时，尽量避免鸡蛋破损。适当调节鸡舍的通风系统，确保合适的风速，防止氨气含量过高。
2、生物学方法
控制苍蝇的生物学方法是在粪便中培养苍蝇的天敌。苍蝇的天敌包括甲虫、螨和黄蜂等。在自然情况下，粪便中苍蝇的天敌较少。干燥的畜禽粪便有利于苍蝇天敌的发育。我们可以定期在畜禽舍的粪便上投放苍蝇的天敌。
3、化学方法
化学药物是控制苍蝇的最有效的方法。化学药物不仅可以杀死苍蝇，也可以杀死蝇卵和幼虫。化学药物分为杀幼虫和杀成虫剂。
目前国内杀灭蝇幼虫剂有（1）有机磷类（2）氨基甲酸酯类（3）昆虫生长调节剂。另外，国内外也有通过饲料途径控制苍蝇的杀虫剂出售，如环丙氨嗪预混剂，在饲料中添加此药，连用4～6周，用于控制畜禽栏舍内蝇幼虫的繁殖。
杀成虫剂：（1）有机氯类（2）有机磷类（3）氨基甲酸酯类
杀成虫剂的施药方法有以下几种：（1）蝇类停止面施药（2）空间喷洒（3）毒蝇绳（4）毒饵。
