消毒是有效清除和杀灭病原微生物，切断传染途径，预防．控制传染病发生、传播和蔓延的根本措施。特别是在当前病原不是十分明确的情况下，针对不同的对象进行消毒便变得十分必要。
消毒需要注意四个方面：①设施设备：房屋、圈舍、饲养用具、运输工具、工作服等。②畜体污物：畜体及排泄物、分泌物、垫料、废料、污水等。③周围环境：门口、通道、库房、宿舍、食堂以及办公场所等。④工作人员；饲养员、兽医及参观人员等。
消毒的方法主要采用以下三个方式：
1．物理消毒；清理、打扫、冲洗；通风、干燥、日晒、高压、蒸煮、火焰等方法。
2．化学消毒：用消毒药物进行清洗、浸泡、喷洒、熏蒸等方法。
3．生物消毒：采用堆积、密封、发酵等方法。
不但有具体的程序，还要有明确的消毒制度。只有按照合理的程序做，消毒的效果才有保证。具体是按照清理、冲洗、药物消毒、无害化处理的顺序实施消毒。
1．清理：清除消毒对象表面的污物、杂物，特别是附着在圈舍地面、墙壁、饲养用具、运输工具上有灰尘、粪便、被毛、垫料、废料、污渍等。
2．冲洗：经过清理后，用动力喷雾器或高压水枪进行冲洗，冲洗按照从上至下，从里至外的顺序进行。注意对角落、缝隙、设施背面的冲洗，做到不留死角。
3．药物消毒：选择碱类、醛类、酚类、卤素类、氧化剂、双链季胺盐等有效消毒药品，采用合适的消毒方法实施药物消毒。一般2～3种不同类型的消毒药交替使用，第一次使用碱性消毒药，第二次使用表面活性剂类、卤素类、酚类等消毒药。
4．无害化处理：清除的垃圾、粪便、垫料、污物以及冲洗产生的污水采用深埋、化制、高温、焚烧、密封发酵等方法进行无害化
处理。
消毒要做好以下几点：
1．猪场门口设立消毒池，长度以进出车辆车轮的2周长以上为宜，可用2%烧碱等消毒液，每周更换1次，保持消毒池内消毒药液的有效性。
2．猪场生产区通道设消毒垫、紫外线消毒灯，饲养人员、兽医进入须穿专用胶鞋和工作服，并用消毒药液洗手。
3猪场生产区道路、圈舍周围环境，可用2%烧碱或生石灰等消毒剂，每周定期消毒1次。
4．猪场排粪坑、污水池、下水道出口每月用漂白粉消毒1次。
5饲养用具每周定期消毒2次。可移动用具冲洗干净后，用0.1%新洁尔灭或0.2%～0.5%过氧乙酸等消毒液消毒，然后在密闭的室内进行甲醛熏蒸消毒。
6．每周定期带猪消毒2次，需选用对人畜无害的消毒液，如百毒杀或0. 2%过氧乙酸等。
7．猪群出栏后和进猪前在彻底清理、冲洗的基础上，进行喷雾或熏蒸消毒。
8．工作人员离开生产区前，工作服放在紫外线消毒间，并每周用消毒药物浸泡清洗1次。
9．来人参观猪场后，需对参观路径或全场进行喷雾或喷洒消毒。
10．发生疫情时，增加消毒次数，并按国家有关规定执行。
