该病重在预防，预防除了加强环境卫生和消毒工作外，主要是进行免疫接种。免疫接种是控制鸡传染性法氏囊病的特异性方法。对种鸡群进行免疫，能使较高的母源抗体传给子代，使雏鸡免受法氏囊病的早期感染；对商品鸡的免疫，能使鸡群保持较高的抗体水平，免受法氏囊病毒的侵袭。常用的疫苗有活苗和灭活苗两类，肉仔鸡和育成鸡用活苗免疫，种鸡在１８～２０周龄和４０～４２周龄可用灭活苗免疫。
免疫前，首先要制订免疫程序，可根据该病在本地的流行特点、疫情状况和自场的饲养治理条件、母源抗体水同等来制订。首免一般情况下应在１４～２１日龄，但考虑到种蛋来历不同、雏鸡来历不同、母源抗体高低不一致等因素，首免日龄应尽量提前，可在５～７日龄进行。但也要考虑到母源抗体的影响，免疫不当有可能会中和疫苗（抗原），使具有较高母源抗体的雏鸡失去抗体。笔者的经验是，首免时加大疫苗用量，可用１．５～２倍量进行免疫，这样即使中和一部分抗原，还会有剩余的抗原继续刺激机体产生抗体，这样可以把雏鸡的抗体调整到同一水平上，首免后２～３周进行第２次免疫。首免最好使用滴鼻或点眼，因其剂量正确，不容易漏防。以后再免疫用饮水或喷雾免疫都可。
