鸡的呼吸道疾病综合症可引起肉鸡生长速度显著降低，料肉比明显提高；蛋鸡和种鸡的产蛋率降低、畸形蛋增多、种蛋孵化率降低、健雏率下降。肉鸡生长过程中容易发生呼吸道疾病，或在免疫呼吸道活病毒疫苗时，非常容易发生严重的疫苗反应，造成药物费用的增加和生产损失。
由于败血支原体和大肠杆菌的混合感染，造成严重的气囊炎、心包炎和肝周围炎等，引起死亡率和淘汰率的显著提高。据统计，种鸡感染败血支原体后，饲料转化率降低10-20%、死淘率上升10-20%；开产日龄推迟2周、峰期产蛋率降5-10%；蛋鸡的产蛋率下降10-20%；种蛋孵化率降低5-10%、雏鸡的弱雏增加10%、肉鸡的体重降低38%、出栏时间延长、治疗成本上升（每只肉鸡多用0.3元）。
