.1大体病变
大体病变主要是鼻道、副鼻道、气管、支气管及气囊的卡他性渗出液。气囊可见有干酪样渗出，但可能呈一种珠状或淋巴滤泡样外观。还有可能观察到一定程度的肺炎。
典型的气囊病例可见有气囊炎、纤维素性或纤维脓性的肝周炎以及心包粘连等三炎病变，引起高死亡率和加工过程中大量被淘汰。但衣原体病和败血症也可引起类似的病变，因此这些不是MG感染的特征性病变。MG引起的商品蛋鸡角膜结膜炎可见其面部皮下组织和眼睑明显水肿，偶尔可见角膜浑浊。
2组织学病变
感染MG的鸡和火鸡的显微病变特征为：感染组织的粘膜，由于单核细胞浸润和粘液腺的增生而显著增厚。粘膜下常见局部淋巴组织增生。
气管纤毛几乎完全被破坏，上皮细胞肿胀，绒毛上粘附有支原体。在气管环培养中，MG感染可引起纤毛运动停止。气管的大体病变和显微病变，尤其是粘膜增厚，已被用作诊断MG感染和发病的标准。
实验感染鸡，气管粘膜从1-2周明显增厚，从2-3周开始变薄。在肺部除肺炎区域和淋巴滤泡变化外，也曾发现肉芽肿病变。有关MG感染鸡气囊的光镜、扫描电镜（EM）和组织形态学检查已有详细报道。
