呼肠弧病毒、腺病毒、细小病毒、冠状、轮状病毒都可成为肠道肠毒综合症发生的诱因，这些病毒引起肠道炎症，损害肠道的吸收功能，感染后肉仔鸡典型症状发育不良，生长停滞及腹泻等
病毒引起的肠炎主要表现为：
1、开始，个别鸡只出现粪便变稀，不成形，粪中含有未消化的饲料
2、随着时间的推移，一般3-5天，整个鸡群大部分开始腹泻，粪便变的不成形，有的鸡群发生水样腹泻，粪中有较多没消化的饲料，粪便颜色略呈浅黄色，严重出现黑色稀便，此病的中后期患鸡会出现频频点头或震颤等神经症状，有的鸡只向前猛冲，有的后退，之后瘫痪、尖叫、疯跑死亡。
主要的病理变化：
1、主要病变在肠道。肠道的浆膜可见出血点或出血斑，肠管膨胀，剪开肠壁自动外翻，肠粘膜增厚，呈麦麸样。
2、有的肠壁由于粘膜脱落而变的菲薄，肠壁质脆易碎，前段充满未消化的饲料碎片，呈水样内容物，后段充满了橘黄色粘液样物质和未消化饲料，呈鱼肠子样、西红柿样、胡萝卜丝样，中后期肠内容物蛋清样，偶有腺胃肿胀的现象。
