由于受台风降雨等影响，养殖对象易受细菌、病毒等微生物感染，易发疾病。对此，舟山市海洋与渔业局积极派出工作人员，指导广大养殖户采取五项措施做好防病工作。
一是及时排出表层淡水，特别留意池水溶解氧的变化，池底溶解氧不足的时候，应增加增氧时间。
二是建议在台风暴雨前后，往饲料中添加复合维生素C、免疫多糖等营养类物质，以增强养殖品种的抗应激能力。
三是对pH值在8.5以内的池塘，可泼洒生石灰。
四是海水虾蟹类养殖要注意寄生虫病的发生，可用纤虫净、纤虫杀等高效药物杀灭虾蟹体表的寄生虫。
五是网箱养鱼要定期换网、洗刷，换网后应及时进行消毒处理，并做好鱼病隔离的各项工作。