1、食道，嗉囊病变；食道粘膜有纵行排列黄色条索状荚膜覆盖或小点出血，假膜易剥离并留有溃疡是鸭瘟特征性病理变化；食道粘膜坏死是毛滴虫病，VA缺乏病变。嗉囊积水，积食，积气，坚实粘膜增厚有溃疡是球虫病，毛滴虫病，异物阻塞，新城疫，中毒，念珠菌所致。
2、腺胃，肌胃病变；
a、腺胃球状增大，壁增厚是马立克氏病，腺胃型传支的病变；腺胃出血有新城疫，禽流感，法氏囊病，喹乙醇中毒，痢菌净中毒，包涵体肝炎等病变；腺胃有小坏死结节预示白痢，马立克氏病，毛滴虫病。
b、肌胃有白色结节是白痢，马立克氏病的病变；肌胃溃疡出血，角质层易剥离是禽流感，新城疫，法氏囊病，喹乙醇中毒，痢菌净中毒，包涵体肝炎所致。
c、小肠病变；充血，出血预示新城疫，禽流感，球虫病，住白细胞原虫病，禽霍乱，葡萄球菌病；小肠有小结节是白痢 马立克氏病结核病病变；出血，溃疡，坏死是魏氏梭菌引起的溃疡性肠炎和坏死性肠炎；有寄生虫属于线虫病，绦虫病等。
d、盲肠病变；盲肠出血溃疡是球虫病，盲肠肝炎；有干酪样物栓塞是白痢 副伤寒盲肠肝炎，小鹅瘟。
e、泄殖腔病变；泄殖腔水肿，出血，充血为新城疫，鸭瘟，啄癖等病变
