多数非常规蛋白饲料原料会有抗营养因子或毒素，必须通过适当处理才能使用。大部分是豆科籽实加工副产品，产品质量和营养价值受到加工工艺影响很大，尤其是氨基酸消化率和可利用率。氨基酸不平衡或缺乏某些限制性氨基酸，替代日粮中豆粕时，注意补充氨基酸。一般适口性差，要注意加工调制。
一、棉籽粕
1、棉籽粕的成分特性
棉籽粕营养价值受到棉酚和环丙烯脂肪含量的影响。纤维含量随去壳程度而不同。氨基酸中赖氨酸少，为第一限制氨基酸，利用率亦差。游离棉酚含量少，其粗蛋白质及赖氨酸利用率较佳。是色氨酸及蛋氨酸之优良来源，利用率比菜籽粕好。维生素A、D少。矿物质中磷多，钙少，磷多属植酸态磷，占71%。
2、棉籽粕的利用
对猪来说品质优良的棉籽粕可取代一半大豆粕而无不良影响，但要补足赖氨酸;品质不好或取代量太高则影响适口性，并有中毒的可能。游离棉酚含量超过0.04%的棉籽粕，在使用上必须很谨慎。产品的不稳定及棉酚毒性问题，一般乳猪、仔猪饲料不推荐使用。种畜应避免使用棉籽粕，以免影响生殖能力。
二、花生粕
1、花生粕的特点
花生粕易感染霉菌，产生黄曲霉毒素。花生壳混入量对成分影响最大。连壳花生粕因含壳多，故纤维高，能量需求高之饲料应避免使用。
2、花生粕的成分特性
花生粕的蛋白质以不溶于水的球蛋白为主(占65%)，可溶于水的白蛋白仅占7%，蛋白质性状与大豆蛋白差异甚大。赖氨酸及蛋氨酸偏低，精氨酸与组氨酸则相当高。脂肪酸以油酸为主，约占53%～78%。维生素除A、D、C外，其他含量丰富。钙少磷多，磷多属植酸态。花生粕含有胰蛋白酶抑制因子，其量约为生大豆的20%，加热即可去除。
3、花生粕的利用
对猪的适口性相当好，因赖氨酸及能量含量低，其价值低于大豆粕，仔猪可取代三分之一大豆粕。肉猪采食太多花生粕时，肉质有变差之趋向，脂肪软化，用量以不超过10%为宜。
