潜伏期一般为2～7天，强毒力株在3天内引起症状，弱毒力株的潜伏期可能延长至2周以上。
最急性病例病情发展很快，往往头天晚上不见异常，次晨已经死亡。急性型病初体温升高，可达44℃，食欲不振，精神萎顿，羽毛松乱，眼半闭或全闭似昏睡，冠和肉髯暗红色，或黑紫色，嗉囊内充满液体及气体，口腔和鼻内分泌物增多，常有大量粘液由口流出，为了排除粘液而时时摇头，呼吸困难，张口呼吸，喉部常发出咯咯声。粪便稀薄，呈黄绿色或黄白色，有时混有血液，味恶臭。发病2～3天后可见有较多鸡只死亡，死亡呈直线上升，有明显的死亡高峰，大约10天左右鸡只死亡呈缓慢下降，没有很快死亡的鸡常发生神经症状，包括翅、腿麻痹，站立不稳，将头歪向一侧而嘴向上等。病程为2～6天，死亡率达90％以上。
发生亚急性或慢性病例，病情较缓，病鸡咳嗽、喘息和减食，严重影响产蛋，常停产1～3周，大多没有腹泻和消化道出血的症状和病理变化。病鸡常出现歪颈仰视等神经症状，也有的在受惊或抢食时突然倒地，抽搐，数分钟后恢复正常。死亡率为5％～50％。
在免疫鸡群中，由于多种因素造成的群体免疫力不均衡而发生非典型性新城疫。育雏和育成阶段发生时，首先表现的是呼吸症状，夜间可见鸡群有明显的呼吸声音，有的鸡表现呼吸困难，伸颈张口喘气，病鸡伴以神经症状出现时，食欲减退或拒食的鸡只增多，病鸡下痢，发病后2～3天，鸡只死亡增加并与日剧增，大约在1周后死亡鸡数量开始下降。成年产蛋鸡发病，主要表现呼吸困难和少数鸡只的神经症状，产蛋量明显下降，鸽蛋、软壳蛋增多，并有少量鸡只死亡。
各种年龄的火鸡也可感染发病，但症状较轻且死亡率不高。鹌鹑感染新城疫病毒后，可能因生殖系统，特别是卵巢受到侵害而导致明显的产蛋率下降，也有少数病鹌鹑呈现肢腿麻痹乃至瘫痪等神经症状，但死亡率一般不高。
