做好环境消毒工作是预防鸭病流行的前提.消毒前的准备 目前用于肉鸭饲养场环境消毒的药物：醛类（甲醛、戊二醛）、碱类（火碱、生石灰）、卤素类（氯制剂有漂白粉、消毒王、灭毒威等，碘制剂有碘三氧）、过氧化物类（过氧乙酸）、季胺盐类（百毒杀）。消毒前要先进行清扫与冲洗，以防有机物（粪、尿、脓血、体液等）的存在影响消毒效果，然后再喷洒药液进行消毒。
为了预防传染病的发生，饲养场必须制定合理的免疫程序以保护鸭群健康。种鸭免疫应避开产蛋高峰，雏鸭免疫应考虑母源抗体的存在。给肉鸭接种疫苗既要减少人力、物力的浪费，又要提高免疫质量，可根据本地区和本场疾病发生情况，适时、适度地引入疫苗进行免疫，例如在鸭传染性肝炎的高发疫区或受肝炎威胁的地区就必须进行鸭传染性肝炎的免疫。
疫苗免疫对肉鸭是一种应激，为了减小这种应激，可在肉鸭的饲料或饮水中添加电解多维。在不同季节，免疫接种要注意不同的细节问题。冬季气温极低，使用油乳剂灭活疫苗时，要先将疫苗恢复至室温，否则注射到皮下的疫苗易形成疫苗团而不易被吸收。夏季气候炎热，接种疫苗时，首先要保证肉鸭饮水充足，并且尽量将免疫时间安排在清晨凉爽的时候；免疫时，要不断摇匀疫苗，使每只鸭都能获得等量有效的抗原免疫；接种组织弱毒疫苗时，免疫时间最好控制在1.5小时内，以防疫苗在温度过高的鸭舍中长时间暴露而影响病毒的免疫活性。
