一、培肥促壮。秋季水产养殖对象相对减缓个体生长供应，主要满足肌体能量储存，适时增加精饲料的投喂能满足养殖对象的需求，不仅能增加产量，而且可有效提高水产品的出塘规格与养殖效益，如河蟹目前就要增加动物性饵料投喂比例以增加其膏黄，鱼、虾类应增加精料的投放，培肥促壮，减少有些品种如青虾的秋季死亡率。
二、控制水质。入秋后早晚气温温差会比较大，容易造成缺氧浮头，会发生泛池。所以，秋季水质透明度控制在30～35厘米，pH8.0～8.5，养殖密度偏大、水色不理想的塘白天做好增氧，晚上加强巡塘。
三、科学防病。秋季是水产养殖病害的第二个高发期，主要是体外寄生虫病和细菌性病。最好普施1～2次杀虫药和一次杀菌药，同时结合内服抗病提高免疫力的药如免疫多糖、VC、大蒜素等预防鱼病。虾蟹池塘要合理控制水草密度和分布，多余的和易死亡的及早捞出，减少水草的腐烂引发的病害及耗氧等。
四、加强巡塘。9月后要加强巡塘，及时清除残余饵料，对河蟹、甲鱼等易逃养殖品种注意查看防逃设置、进出水口防逃设施和池埂有无漏洞；夜晚加强防逃、防盗巡视。
五、适时上市。上市时间和进度要考虑池塘的载鱼(虾)量、起捕水温及下年生产安排等因素灵活销售。部分品种如鳜鱼、加州鲈鱼等合理控制饵料量和存塘密度，减缓其生长，到明年清明前后开始上市。