一、运输种羊前，首先办理好产地检疫和过境检疫相关手续。
二、要在装羊的车箱内铺一层农作物秸秆，或者在箱板上洒一层干燥的沙土，防止羊在运输过程中滑倒而相互挤压致死。
三、种羊在运输前，要提前选好行车路线，尽量选择道路平整离村屯较近的线路，如有特殊情况便于处理。
四、运输车辆的车况要好，手续齐备，装有高栏，防止羊跳车。配带苫布以备雨雪天使用，根据运程备足草料及水盆、料盆等器具，并且带少量消炎止痛等药品。
五、装羊时，不能过密过挤。体质强弱羊、大小羊、公母羊，在车上打隔分开。对妊娠母羊不能托肚子装车，以防流产。哺乳羔羊要按时哺乳，每天不能少于4次，白天哺乳间隔不宜长于5小时。
六、上车前要给羊饮足水，不宜让羊吃得过饱。运程在1天之内的不需要喂草喂料，运程在1天以上的，每天应喂草2~3次，饮水不少于2次，保证每只羊都能饮到水、吃到草料。
七、运输车辆应缓慢启动，禁止突然刹车，在颠簸路面和坡路要缓慢行驶，防止羊挤压死亡。中途停车或人员休息要安排专人看护羊，防止羊跳车或被盗。
八、押车人员要经常检查车上的羊，发现怪叫、倒卧羊要及时停车将其扶起，安置到不易被挤压的角落。
九、运到目的地后，卸羊时要防止车厢板与车厢之间缝隙别断羊腿。最好将车靠近高台处卸羊，防止羊跳车造成流产、伤羊等事故发生。
十、将种羊卸车后，不要立即给种羊饲料，应先给种羊饮水，待半天后一切正常时，再由少到多地逐渐给种羊喂料。