鳝受精卵的孵化率受多种环境因素影响，其中主要是水温、溶氧和敌害生物。
（1）水温黄鳝的胚胎发育与水温的关系极为密切。主要表现在三个方面：一是胚胎发育必须在适宜的水温下进行，过高过低，都会引起孵化率下降或胚胎畸形。研究表明，黄鳝胚胎发育的适宜水温是21～28℃，最佳水温为24～26℃；二是在适宜的水温差范围内，水温差过大或过快也会引起胚胎畸形或死亡，通常要求短时间内温差变化不要超过3℃，最好不超过1℃；三是黄鳝胚胎发育时间的长短直接受水温影响，在水温30℃左右（28～36℃），胚胎发育需5～7天，在水温25℃左右，胚胎发育需9～11天。
（2）溶氧黄鳝的胚胎不能利用空气中的氧气，只能利用血管等渗透吸收水中溶氧，水中溶氧过低会引起发育迟缓、停滞，甚至窒息死亡。试验表明，24℃水温条件下，100粒黄鳝卵每小时的耗氧情况是：细胞分裂期为0.29毫克，囊胚期为0.46毫克，原肠期为0.53毫克，远远高于“四大家鱼”胚胎发育的耗氧量。因此，在孵化过程中，孵化用水的含氧量应接近或达到水体溶氧的饱和度。
（3）水质清新的水质对提高孵化率有很大作用，绝不能用农药或工业污染的水作孵化用水，最好建蓄水池或安排专池提供孵化用水，且引用前要过滤以防敌害生物和污物进入，影响孵化率的提高。水的pH以中性为好。
（4）敌害生物在人工繁殖条件下，较大的敌害生物易被清除（如蝌蚪、小鱼、小虾等），但体形较小的剑水蚤等却容易被忽视，事实上，剑水蚤对鳝卵和仔鳝形成较大威胁，它们能用附肢刺破卵膜或咬伤鳝苗，进而吮吸鳝卵、鳝苗为营养，受害的鳝卵或鳝苗很快死亡。对剑水蚤预防的最好办法是将孵化用水进行过滤，过滤网安装在进水口处。