1、机械性疗法捏破法 此法是通过直肠壁握住囊肿卵巢，用手指把囊肿捏破，但一般在激素处理无效或一时得不到激素的情况下，捏破法仍是有用的，特别是对慕雄狂母牛可多次捏破。
穿刺法 难于用手捏破的卵巢囊肿，可以用针或卵巢手术刀，通过阴道壁，刺破囊肿放液或用抽吸器抽出囊肿液。
2、激素疗法促黄体素 其肌注量为100-200国际单位，孕马血清注射用量为5000国际单位，一般1次治愈率平均为75%左右，常在治疗后20-30天内恢复发情周期，不需重复用药。
孕酮 实践证明，应用外源性孕酮治疗卵巢囊肿可使60%-70%的病牛恢复性周期循环，50%可在处理后45天左右受孕。对具有慕雄狂的病牛效果更显著，一般注射2-3次孕酮的病牛慕雄症状消失，经过10-20天恢复正常发情，而且可以受孕。孕酮采用长期处理效果更好，其中，孕酮阴道栓是一种简便的处理方法。孕酮肌肉注射剂量一般为50-100毫克/次，注射2-3次后母牛发情症状消失，经10-20天恢复发情周期，有效率60%-70%.对隐性型采用肌肉注射黄体酮100-150毫克和维生素AD10毫升，每日1次，5天为一个疗程，连续2个疗程，治愈率可达90%以上，对显性型采用黄体酮、维生素AD和孕马血清2000国际单位交替肌肉注射，6天为1个疗程，一般为1-3个疗程，治愈率可达80%以上。
促性腺激素释放激素 其使用剂量为肌注或静脉注射50-250微克，促黄体激素释放激素20毫克/次肌肉注射。促性腺激素释放激素及其类似物在处理后2.5-3小时内能引起病牛出现与排卵相似的促黄体素峰。它能引起和加速囊肿或正常卵巢中成熟卵泡黄体化，约1周后出现类似正常性周期的黄体期，于处理后的30天内便有80%左右的牛进入正常发情期。促性腺激素释放激素处理后19-35天内，80%以上的病例治愈，第一次输精妊娠率达49%-65%，同时还有预防作用，产后第12-14天给母牛注射该激素，可以制止卵巢囊肿的发生。
前列腺素 其是牛黄体的强溶解剂，用其处理诱发囊肿黄体溶解和血清孕酮浓度下降后，1-8天出现正常性周期。黄体囊肿患牛肌注氯前列腺烯醇0.4-0.5毫克，在8天内有87%-96%治愈，12-27天内输精妊娠率达53%-78%.其治疗黄体囊肿可很快见效。
催产素 其对卵巢囊肿确实有疗效，1天连续2次，用量200单位/头。次，患牛在2周后大都发情、排卵。
3、其他疗法碘化钾 缺碘和甲状腺机能亢进都被认为是母牛卵巢囊肿的部分原因。卵巢囊肿母牛连续7天每天饲喂3-10克碘化钾，16天后约有71%治愈，20天后100%治愈，愈后妊娠率达87%.碘化钾还可以诱发母牛发情。
