4.1.5 DNA疫苗可用于变异频繁或血清型较多的病原免疫预防 DNA疫苗在对变异频繁或血清型较多的病原免疫预防过程中，对于目前多价活毒疫苗防治的疾病预防和治疗有重要意义。易变异的病原如流感病毒、轮状病毒、蓝舌病病毒、口蹄疫病毒、鸡传染性支气管炎病毒。
4.1.6 质粒DNA无免疫原性，可以反复使用 这一特点对具有母源抗体的动物尤为重要。
4.2 DNA疫苗的安全性
DNA疫苗具有传统疫苗所没有的优越性，但是真正运用于人体还有许多问题有待解决。
载体DNA整合到宿主基因组内，有导致不利转化的可能，如通过癌基因的插入，导致宿主原癌基因的插入活化或抑癌基因的失活等，如果基因疫苗散布到生殖细胞，并发生整合，则影响更为深远[18-22]。
免疫效果有待提高。实验动物越大，基因免疫效果越差，在小鼠试验中，检测到抗体反应高，而到其它大型的动物效果就不是很明显。
抗DNA免疫反应。质粒DNA会不会诱发抗双链DNA的自身免疫反应，可能引起自身免疫性疾病(系统性红斑狼疮)，正常人体中可以存在抗菌ssDNA和dsDNA抗体，而不存在抗自身的dsDNA抗体。利用细菌DNA免疫接种，可以诱导产生抗哺乳动物ssDNA抗体，但无抗哺乳动物dsDNA抗体的。还有DNA疫苗中含原核基因组中常见的CpG基序，易形成抗原决定簇[21]。
5 结语
DNA疫苗开创了免疫学和疫苗学的新领域。越来越多的试验研究发现，DNA疫苗在免疫防御方面有良好的效果，但DNA疫苗还面临着许多挑战，比如DNA疫苗接种的免疫学机理，有关核酸疫苗在理论上的安全性问题等方面，还需要进一步的试验加以阐明。
现在普遍认为，DNA疫苗应先用在传统方法无法对付的病原体和疾病上。如HIV、肺结核、疟疾、乙肝、丙肝、流感和支原体等。在另一个方面，DNA疫苗的优势是它的治疗作用。相信随着研究的深化，DNA疫苗将会逐一解决现有的问题，在更多的领域中发挥作用。