羊近亲交配容易造成“两降一高”的弊病，即：羊只生产性能下降，品种退化，生产发育迟缓，产肉量、产毛量降低；繁殖率下降，怪胎、流产、化胎、死胎不断出现；羊只抗病力差，死亡率高。要解决这些问题，有三条办法：
（1）调换种公羊。在一个羊群中，种公羊连续使用两年后，应与其他羊群中同一品种的种公羊进行调换。降低近亲交配次数。
（2）单养种公羊。到配种季节，选择血缘关系远的种公羊进行人工辅助配种或人工授精。这种方法不仅可以避免近亲繁殖，而且可以控制母羊产羔时间，延长种公羊利用年限。
（3）建立人工授精站。在养殖集中的乡、村，应建立羊只人工授精站，并建立档案制度，包括种公羊、母羊信息卡，母羊繁殖登记表，羔羊登记表及后代测定记录表等。这样，血缘关系就一目了然，从而可以有计划地选种选配，避免近亲繁殖。
