目前应用于中药脱色的方法及工艺很多，但大致可通过以下方法进行分类。
一、根据色素在不同溶剂中的溶解度差别进行除去
属于最常用、最简单、也是效果比较差的方法。
1．水提醇沉：可去除小部分水溶性色素。
醇提水沉：可除去大部分脂溶性色素。（也可以两种方法交替使用）
2．酸碱沉淀法：例如当杂质色素是一些黄酮、蒽醌等酚酸性成分时，可调节PH3以下，另其析出。
二、根据色素在两相溶剂中的分配比不同进行除去
例如当杂质色素是一些黄酮、蒽醌等酚酸性成分时，可采取调节PH到12以上，用有机溶剂萃取的方法。这时由于色素都以解离形式存在，不宜被萃出。
三、根据色素与有效成分吸附性差别进行分离
1．物理吸附：（吸附力是分子间力）
（1）极性吸附剂：如硅胶、氧化铝。可去除亲水性色素。
（2） 非极性吸附剂：如活性炭，纸浆、滑石粉、硅藻土。可去除亲脂性色素。
活性炭是一种优良的吸附剂，它对色素、细菌、热原等杂质有很强的吸附能力，并且其还有助滤作用。
其内部有大量的微孔和空隙，表面积可达200-500m2/g。
吸附原理：由于大多数色素具有共扼双键结构，易吸附。
使用方法：冷吸附法，热吸附法，炭层助滤法，柱层析吸附法。
2．化学吸附：
（1）例如可用碱性氧化铝去除一些黄酮、蒽醌等酚酸性色素。
（2）离子交换树脂法：例如黄酮、蒽醌等酚酸性色素可以用阴离子交换树脂除去。
3．半化学吸附：聚酰胺与大孔树脂。吸附原理为氢键作用，大孔树脂还有部分范德华力作用。
聚酰胺可通过分子中的酰胺羰基与酚类、黄酮类的酚羟基形成氢键。也可一通过酰胺键上的游离胺基与醌类、脂肪羧酸上的羰基形成氢键。
四、沉淀法除去色素
代表物质：石灰乳。
常用浓度：20％－30％。
脱色原理：石灰乳中钙离子能与药液中的有效成分及杂质结合成钙螯合物、钙盐沉淀。而沉淀在硫酸作用下，黄酮、蒽醌、酚类、皂苷、部分生物碱与钙离子形成的钙盐可以被分解出来，再溶解到水中。但是鞣质、部分蛋白质、有机酸、极性色素、多糖等不能分解出来。
五、絮凝剂法除去色素
1．常用的絮凝剂分以下几种：
（1）明胶类：鞣质影响药液稳定性且容易变色。可利用明胶与鞣质行政络合物，与水中悬浮颗粒一起沉淀
（2）ZTC1+1天然澄清剂：
分为四种：I型：除蛋白型
II型：脱色澄清型
III型：中药口服液与颗粒剂型，可代替醇沉法，起到去除不稳定成分和助滤作用。
IV型：注射液型，主要提高澄明度。
（3）101果汁澄清剂：
（4）甲壳素及壳聚糖：壳聚糖是甲壳素乙酰化制得。它们都是天然的阳离子絮凝剂。
2．影响澄清效果的因素
（1）澄清剂的用量
（2）澄清剂的配制浓度和加入顺序
（3）药液本身的浓度
（4）絮凝时温度的影响
（5）药液的PH的影响
（6）搅拌速度和搅拌时间的影响
（7）絮凝沉淀时间的影响
六、膜分离去除色素
最常用的为超滤技术。