制约生猪产业发展的因素很多，其中最主要的因素是成本和病害问题。母猪是生猪产业中最重要的环节，从母猪开始饲养到生产出商品猪，大约需要18个月的周期。今年猪肉价格波动，其中一个重要原因就是由于2005年和2006年农民宰杀母猪过多，仔猪供给不足，从而引起今年生猪存栏数量减少和市场供应不足。因此，要恢复生猪生产，必须鼓励饲养母猪。建立母猪保险和饲养补贴制度，就是建立稳定生猪生产的长效机制。通过母猪饲养补贴，降低了养殖成本，增强了饲养者抵御成本上涨风险的能力，稳定了生猪产业的龙头。而母猪保险制度建立之后，凡因病害、灾害造成母猪死亡的，由保险公司给予赔偿，这一举措又降低了养殖户面对病害和灾害的风险。财政部经建司司长胡静林表示，通过将母猪保险与补贴相结合，既可免除养殖户的后顾之忧，激发其养殖积极性，又可以建立起一种长效机制，促进生猪生产逐渐从散养转为集约化生产。
能否建立一个科学合理的母猪数量核实机制是这次补贴政策的重点和难点。在财政部长金人庆的亲自指导下，财政部提出了建立母猪保险与补贴相结合的制度这样一个崭新思路，通过招标的方式，引入保险公司为第三方，通过利益机制，由保险公司来核实母猪数量。保费由国家财政按比例进行补贴，考虑到地区间财力差异，对中西部地区的保费，中央财政补助50%，地方负担30%，饲养户负担20%；而东部地区的保费则由地方财政和饲养户承担。这样做不仅激发了保险公司的积极性，而且调动了地方政府的主动性，可以充分保证财政资金的安全，保障母猪饲养者的利益，并开创了补贴资金管理的新模式。
通过保险制度确定了母猪的数量后，财政部门再通过国库集中支付，将饲养补贴直接发放到饲养户手中。借鉴粮食直补的成功经验，已建立“一卡通”的，要求尽量通过“一卡通”直接将母猪补贴发放给农民，最大限度地减少了中间环节。考虑到地区间财力差异，中央财政对中西部地区补贴按60%予以补助，中西部地区自己负担40%，东部地区全部自行负担。
