第一，基础方法发明。例如，200410070312．6号文献涉及一种生物分子形状的转录方法，步骤为，在基片上二维排列生物分子；在该生物分子上形成由无机物质组成的薄膜层；在该薄膜层上形成支持层；将该薄膜层和该支持层一起从上述生物分子上剥离。再例如，03141844．9号文献涉及一种双探针基因芯片信号放大方法。200410057323．0号文献涉及一种空间相位调制干涉阵列检测生物芯片的方法及系统。200410064799．7号文献涉及一种生物芯片定量检测方法。02136370．6号文献涉及一种多标志物生物芯片信号分析系统。02825869．X号文献涉及一种用于测量微阵列上磁性纳米粒子面密度的方法。
此外，200310111884．X号文献涉及一种基于投影的生物芯片扫描图象点阵自动识别算法。96198521．6号文献涉及一种用于主动可编程矩阵器件的设备和方法。03808648．4号文献涉及一种以部分氧化多孔硅为基础的装置及其制造方法。200410086248．0号文献涉及一种微量液体喷射系统。200410041365．5号文献涉及一种利用光子微粒编码的微通道阵列式生物芯片及应用方法。03100093．2号文献涉及一种制备核酸探针库的方法。03102659．1号文献涉及一种用于生物分子芯片微量加样和反应的方法。
第二，分子检测方法发明。例如，200410029590．7号文献涉及一种检测小分子化合物的方法，包括如下步骤：用封闭液封阻生物芯片上的非点样区域；在生物芯片上的点样区域内加入待测样品或其制备液及小分子化合物特异配体的混合液，进行反应；通过检测小分子化合物的特异配体，确定小分子化合物是否存在及其含量。此外，200410066255．4号文献涉及一种生物芯片时分复用多荧光同时检测方法。
再例如，200410034942．8号文献涉及一种广谱的生物分子检测方法。它用酶免吸附原理制作亲和试剂，然后用该亲和试剂对检验样品中的靶物进行特异性富集，提取靶分子，然后把靶分子放入反应器内置有固化引物的反应孔中，再进行PCR扩增，扩增时各孔内的固化引物融化并共同参与扩增，最后根据荧光信号分析结果。它采用ELISA、生物芯片、PCR技术，能同时检测多种核酸、蛋白质或其他生物大分子，可对人体、动植物、微生物、食品、环境等进行检测，用于疾病诊断、食品检测、商检、环保评估检疫等。
第三，通用生物芯片发明。例如，03126910．9号文献涉及一种质量放大的压电生物芯片，包括压电晶体基片和上下表面的传感电极。其特征在于：至少一个完整的BAW传感器，上下表面传感电极皆由半导体电子芯片的金属工艺形成。每个电极使用至少一次光刻工艺成形，并与其它部件密配。电极可用金、银以及其它一切与生物兼容的导电材料直接制成；或用其它金属导电材料制成，然后再覆盖与生物兼容的导电或绝缘材料实现生物兼容性。此外，03143675．7号文献涉及一种聚二甲基硅氧烷夹心式微流体生物芯片。
第四，特种生物芯片发明。例如，03139836．7号文献涉及一种病毒生物芯片，芯片内部由单片机控制器、仿生电场脉冲产生器、整形器、调制器、输出器、提示器构成。它可被戴、贴在人体手腕上部按脉博位置，或者手腕下部靠内侧位置，适合呼吸道自限型流感病毒、SARS病毒的预防与早期治疗。
第五，制备工艺发明。例如，200410014714．4号文献涉及一种微阵列生物芯片的卷筒式制造工艺：首先，根据待制备的生物芯片上所分布的探针，选取修饰了这些探针分子的内含孔结构的材料，将其制成直线形状。其次，根据待制备的生物芯片上的探针分布情况，将上述直线形状的修饰有探针分子的内含孔结构的材料平行摊铺在另一软固体基片上。第三，在基片表面涂刷粘结剂后，沿着与修饰有探针分子的直线形状材料的摊铺方向卷动软固体基片，使修饰有探针分子的内含孔结构的直线形状材料随此卷动而被夹于卷后基片的不同部位之间，直至基片被卷成卷筒形状。第四，沿着与修饰有探针分子的内含孔结构的直线形状材料相垂直的方向，机械切割卷筒形状的基片，得到微阵列生物芯片。此外，200410014716．3号文献涉及一种微阵列生物芯片的制备方法。200410014718．2号文献涉及一种微阵列生物芯片的层式制造工艺。03157324．X号文献涉及一种生物芯片的制作方法。
第六，蛋白质芯片制备、检测方法发明。例如，03126940．0号文献涉及一种蛋白芯片的制备方法，包括如下步骤：准备好含有足够量的活化基团活化处理的玻璃芯片片基；将待点样的蛋白质抗原和质控蛋白用点样缓冲液进行梯度稀释；点样设计；点样后在室温下放置3小时；用含1％BSA的PBS封闭1小时；在真空干燥箱内干燥后装在有干燥剂的袋中密封保存6个月。此外，200410090423．3号文献涉及一种基于生物芯片检测核酸结合蛋白的方法。
第七，生物芯片操作方法发明。例如，200410014793．9号文献涉及一种生物芯片的检测方法：待检样本与生物芯片及配套试剂反应后，生物芯片上的生物信息被识别仪识别、读取，然后进行检测，其检测步骤包括仪器校正、手动套圈、生物芯片系数校正等。此外，200310112558．0号文献涉及一种乙型肝炎病毒拉米夫定耐药基因芯片用法。
第八，生物芯片应用技术发明。例如，200410088889．X号文献涉及一种高通量生物芯片的应用方法，包括如下步骤：沿与生物芯片上样品带相交的方向在固相基质表面制作上若干条与样品对应的检测分子线，使检测分子与固定在固相基质上的样品反应；清洗固相基质后检测信号点。此外，200310103143．7号文献涉及一种用生物芯片及质谱仪联合检测多种病毒微生物标记的用途。200410046790．3号文献涉及一种一维生物芯片及其在基因、蛋白表达分析中的应用。02125914．3号文献涉及一种高通量细胞生物芯片检测技术及试剂盒。03156556．5号文献涉及一种用蛋白生物芯片检测SARS患者血液中生物标记的用途。200410041366．X号文献涉及一种基于微球的微流控生物芯片。03156852．1号文献涉及一种扫描式生物芯片仪。03156851．3号文献涉及一种显像式生物芯片仪。
第九，扫描仪发明。例如，03149777．2号文献涉及一种矩阵式生物芯片CCD扫描读取装置。它由激发光子系统、释放荧光收集子系统、X－Y扫描平台子系统以及检测子系统组成，激发光子系统产生单色均匀激发光照射场，受检测矩阵式生物芯片由X－Y扫描平台子系统承载并置于单色均匀激发光照射场中，并被X－Y扫描平台子系统驱动完成整个扫描读取过程，释放荧光收集子系统收集并分离出受激发后矩阵式生物芯片发射的荧光图像，检测子系统将荧光图像光强信号转换为电信号并储存、显示。此外，200410025641．9号文献涉及一种提高生物芯片激光共聚焦扫描仪灵敏度的方法。
第十，分子筛、模具和基片发明。例如，200310119099．9号文献涉及一种单分散纳米铈离子改性介孔氧化硅材料合成方法，尤其涉及一种单分散纳米Ce－MCM－41分子筛的合成方法。它用阳离子表面活性剂为模板剂，三嵌段共聚物为助剂，硝酸亚铈为铈源，在温和碱性条件下，形成溶胶反应液，进而合成出单分散纳米Ce－MCM－41分子筛。此外，200410073433．6号文献涉及一种聚二甲基硅氧烷微流控芯片复型光固化树脂模具制作方法。200410069327．0号文献涉及一种用于荧光仪器校准测量的校准基片及其制备方法。