产生破损蛋的原因很多，遗传因素、年龄因素、饲料因素、应激因素、设备因素等等。
遗传因素主要是蛋壳品质的优劣与破损率呈正相关，并受遗传因素的影响。因品种或品系的不同，蛋壳品质有着一定的差异，因而会进一步影响破损率；同一品种(品系)蛋鸡产蛋率不同时破损率也可能不同。通常来说，白壳蛋比褐壳蛋的破损率高，褐壳蛋比粉壳蛋破损率高，产蛋量高的鸡比产蛋量低的破损率高。
年龄因素和饲料因素，一般而言，初产鸡所产的蛋蛋壳强度较低，破损较多，之后随着周龄的增加，蛋壳强度逐渐增大，再后蛋壳强度降低，破损率也较高。突然更换饲料，调整日粮结构，或饲喂变质、发霉、有异味、适口性差的饲料，产蛋鸡的日粮中钙、磷比例不当或不足，维生素D3缺乏，电解质失衡，微量元素锰缺乏，饲料代谢能水平高或粗蛋白水平低等原因，均会使蛋壳易于破损。
应激因素，如鸡舍光照不当、温度不宜、湿度高、密度过大、噪音干扰、空气质量差、通风不良等应激因素均可影响蛋壳的形成及其质量，造成破损率增加。当鸡只发生传染性支气管炎、新城疫、减蛋综合征等传染病时，会造成输卵管病变，影响蛋壳形成的能力，使蛋壳质量明显下降，破损率增加。而在为治疗疾病用药时，不合理用药或药物的副作用也能破坏蛋壳分泌腺体的正常机能，扰乱体内钙和维生素D3及其代谢物的吸收和排泄，进而影响蛋壳的质量。如在产蛋期间接种疫苗，会导致产蛋量下降，蛋壳质量降低，破蛋率上升。
设备因素，集蛋设备设计不合理或安置不当，如底网坡度过大或过小都会影响鸡蛋滑落速度(鸡蛋滑落速度过快，容易跌落；过慢，则容易被鸡只踩破)。笼养时，笼底铁丝过硬过粗、蛋槽变形弯曲等因素，均会造成破损蛋增多。
其他因素，平养鸡群产蛋箱不足、垫草少或捡蛋不及时，散养时场地硬杂物多，饲养密度过大，或鸡只患有啄蛋癖等因素均会使破损蛋增加。笼养母鸡大多采用站姿产蛋，导致破损蛋增多。自动集蛋系统所捡鸡蛋的破损率一般高于人工捡蛋。日捡蛋次数过少也会使破损率增高。
