有些养猪人知道如何正确采集饲料及其原料，但有很多人没有受到正规训练来正确获得进行水质分析的水样。水样同饲料及其原料样品有很大的不同。
正确采集水样有以下注意事项：
用来测定细菌和藻类含量的水样必须用消过毒的容器来盛。
用肥皂彻底洗手，戴一双一次性手套减少样品污染的机率。
采集样品前必须用丙烷火焰对水龙头的末端和内壁用丙烷火焰或一次性丁烷灯消毒，消毒后不能擦拭水龙头末端。
不要在漏水的水龙头上采集水样，任何水龙头都无法提供软化、过滤或者经过其它处理的水；或者将水管直接连在水龙头上使用即可。
让水流流二分钟，流水的作用是清洗管道，以便采集到干净清洁未受污染的水样。
打开消毒容器时务必小心，不能触摸，也不能污染瓶的内壁和盖子。
将容器加满水，但不能溢出。用瓶子采集水样时不能让水流到自己手上。
接满水样后迅速盖上瓶子。
水样需要冷藏，并在36小时内（6小时内最为理想）送至实验室，最好是使用冰盒来盛装。邮寄水样的可信度低于手工运送的水样。
特别注意：很多实验室都不会在周五或放假前接收样品。
