1、镜检。无菌操作采取坏死肝组织，用两张玻片作肝组织压片，火焰固定，革兰氏染色后镜检，可见革兰氏染色阳性、有内生芽孢的杆菌。
2、细菌分离培养。无菌操作采集病死鸭肝脏和脾脏，划线接种于普通营养琼脂培养基和色氨酸磷琼脂培养基，普通营养琼脂培养基和置于37℃下24小时后观察，可见白色、圆形、隆起、半透明的菌落，经涂片、染色和镜检，可见菌体形态与压片相同。
3、生化物性。挑选典型菌落接种于糖发酵管发酵葡萄糖、蔗糖、甘露糖、困糖、麦芽糖和棉子糖，产酸产气；不发酵乳糖、鼠李糖、山梨醇。不液化明胶，不产生吲哚和亚硝酸盐。
4、药敏试验。该菌对链霉素高敏，对恩诺沙星、环丙沙星中敏，对青霉素、新诺明不敏感。
根据临床症状、病理变化、实验室检查，诊断该病是由魏氏梭菌引起的坏死性肠炎。
