按种蛋标准，蛋重必须在50克以上才能用于孵化。一般要到6～7月龄才能收留种蛋，种蛋重量过小孵出的雏鸡体重也小。根据我们对褐壳蛋鸡的蛋品质分析结果，从蛋重、蛋壳厚度和强度、哈氏单位以及蛋中血、肉斑率的变化资料来看，种蛋留种时间以28～56周龄期间为好，能保证有较高的种蛋合格率、孵化率和健雏率。
平养的种鸡每天应捡蛋4～5次，以减少脏蛋，笼养种鸡至少2小时捡蛋1次。勤捡蛋的目的是减少蛋的破损和防止细菌污染。捡出的种蛋，经初步挑选后即送入种蛋库进行消毒保存，最好用福尔马林薰蒸消毒，以杀死附着在蛋壳上的病原体。方法是每立方米空间用福尔马林14毫升，高锰酸钾7克，薰蒸0.5～1小时。消毒过的种蛋保存在10～16℃，湿度75％的种蛋库中待孵化或外运，种蛋保存期最好不超过1周，以免降低孵化率。如果因故而延长保存期，种蛋的小头应朝上，以防水分蒸发，气室变大。种蛋保存期延长，种蛋的死胚增加，孵化率也降低。
